【摘 要】
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【目的】本研究的目的是筛选和验证与喉癌(Laryngeal carcinoma)预后相关的上皮细胞-间充质转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)基因,并开发一个由多个EMT基因构建的预后风险模型。通过免疫组化实验检测EMT基因在喉癌中的表达,进而探究其与喉癌临床病理参数的关系,以期为喉癌的预后评估提供参考。【方法】1、从TCGA数据库下载转录及临床病理相
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【目的】本研究的目的是筛选和验证与喉癌(Laryngeal carcinoma)预后相关的上皮细胞-间充质转化(Epithelial-mesenchymal transition,EMT)基因,并开发一个由多个EMT基因构建的预后风险模型。通过免疫组化实验检测EMT基因在喉癌中的表达,进而探究其与喉癌临床病理参数的关系,以期为喉癌的预后评估提供参考。【方法】1、从TCGA数据库下载转录及临床病理相关数据集。利用R软件筛选EMT相关差异表达基因(Differentially expressed genes,DEGs),并进一步对筛选出的DEGs进行分类及功能分析。2、通过单因素、多因素Cox分析对DEGs进行再次筛选,可以得到与喉癌预后密切相关的关键DEGs,最终我们利用这些关键DEGs构建喉癌预后风险模型。3、为了更直观的阐释DEGs和喉癌患者的预后相关性,我们的研究也绘制了Kaplan-Meier生存曲线、风险曲线、接受者工作特征(Receiver operating characteristic,ROC)曲线及诺模图(Nomogram)。4、应用SP法对28例喉癌组织、18例声带息肉组织进行免疫组织化学实验,观察两组中CFTR的表达,结果采用免疫组化H-score评分方法进行统计分析,并进一步分析其他影响因素与CFTR表达量的相关性。5、使用R x64 4.0.2和SPSS 26.0对实验数据进行整理及分析。【结果】1、我们建立了由FCN2、CFTR、HOXB7、MMP1、PPARG、SKIL这6个基因组成的预后风险模型,来评估喉癌患者的预后。2、我们将所有喉癌患者分为风险分数高低不同的两组,通过绘制风险曲线(Exposure curve),得到高风险组患者预后较低风险组差。3、通过多因素Cox回归分析我们发现,风险分数可以作为喉癌的独立预后因素。4、通过绘制ROC曲线发现,与种族、肿瘤分期、分级、病原体核酸检测(Nucleic acid testing,NAT)、外科手术残余相比,6个基因计算的风险分数(Risk score)在预测喉癌患者预后方面表现良好。5、免疫组织化学实验结果:喉癌组CFTR表达量明显高于声带息肉组(P<0.05)。在喉癌组中,CFTR的表达与年龄、性别、吸烟和饮酒无关(P>0.05),与肿瘤分化、淋巴结和远处侵袭、临床分期、复发和死亡有明显相关性(P<0.05)。6、联合检测FCN2、CFTR、HOXB7、MMP1、PPARG、SKIL基因在喉癌的表达,对临床上预测喉癌患者的预后有重要意义。【结论】1、本研究利用FCN2、CFTR、HOXB7、MMP1、PPARG、SKIL这6个EMT基因构建了一个可以预测喉癌患者预后的多基因模型,为临床上评估喉癌患者的预后提供了新的思路。2、CFTR在喉癌中表达量高于声带息肉,差异有统计学意义。3、CFTR在喉癌中的表达量与年龄、性别、吸烟、饮酒无关,与肿瘤分化、淋巴结及远处侵犯、临床分期、复发死亡密切相关。
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