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目的:本研究拟探索人肿瘤坏死因子样配体1A(TNF-like ligand 1A,TL1A)的水平及肿瘤坏死因子超家族15(tumor necrosis factor superfamily 15,TNFSF15)基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与原发性胆汁性胆管炎(primary biliary cholangitis,PBC)发病的关系,并对关联分析阳性的SNP位点进行功能预测,以期为今后筛查PBC高危人群及发现新的治疗靶点提供线索。方法:1、收集PBC患者和健康对照者外周静脉血,分离血浆和血细胞,密度梯度离心法分离外周血单个核细胞(Peripheral Blood Mononuclear Cell,PBMC),提取基因组DNA和RNA。2、酶联免疫吸附试验(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)检测健康对照者和PBC患者外周血血浆TL1A的水平。3、实时荧光定量PCR检测PBC患者和健康对照者PBMC中TNFSF15基因mRNA的相对表达量。4、筛选目标SNP位点。应用Sanger测序技术对研究人群的目标SNPs进行基因分型,分析SNP位点不同等位基因与血浆TL1A水平的相关性。5、应用生物信息学软件JASPAR对关联分析阳性的SNP位点进行功能预测。结果:1、PBC组血浆TL1A水平(31.45±17.03 ng/L VS 19.64±5.74 ng/L)显著高于健康对照组(P<0.05)。血浆TL1A水平预测PBC的ROC曲线下面积为0.838,大于机会参考下面积(P<0.05)。2、荧光定量PCR检测结果:PBC组TNFSF15基因mRNA的相对表达量高于健康对照组2.975倍(P<0.05)。3、选取了TNFSF15基因的6个SNP位点:rs55717217、rs6478108、rs4979462、rs10114470、rs1857335、rs12235514。其中,PBC组和健康对照组间rs55717217、rs6478108、rs4979462、rs1857335位点基因型和等位基因频率分布有统计学差异(P<0.05),其余两个位点无统计学差异。4、相关性分析结果:血浆TL1A水平与AST、ALT、ALP、GGT和TBA呈正相关关系(r=0.202,P=0.002;r=0.252,P<0.001;r=0.313,P<0.001;r=0.328,P<0.001;r=0.129,P=0.046),与TBIL、DBIL、ALB不存在直线相关关系。PBC组不同自身抗体组间血浆TL1A水平分布无统计学差异(P>0.05)。rs55717217、rs4979462、rs1857335位点的次要等位基因与血浆TL1A水平升高相关(P<0.001,P<0.001,P=0.002)。5、SNP功能预测结果:rs4979462、rs55717217、rs1857335位点分别是类视黄酸受体α(retinoid X receptor alpha,RXRA)、叉头盒蛋白L1(forkhead box L1,FOXL1)、特异性蛋白1(specificity protein 1,SP1)的潜在结合位点。结论:1、PBC患者外周血中TL1A的水平和TNFSF15基因mRNA的表达显著高于健康对照者,血浆TL1A水平与肝胆系统损伤的严重程度有关,血浆TL1A水平有可能成为PBC诊断的生物学标志物。2、TNFSF15基因的rs4979462、rs55717217、rs6478108、rs1857335位点基因多态性与PBC的易感性相关,rs10114470、rs12235514位点基因多态性与PBC无关。其中,本次研究首次发现rs55717217和rs1857335位点多态性与PBC易感性相关。rs4979462、rs55717217、rs1857335位点基因多态性与血浆TL1A的高表达具有相关性。3、rs4979462位点可能与转录因子RXRA结合,rs55717217位点可能与转录因子FOXL1结合,rs1857335位点可能与转录因子SP1结合,从而促进TNFSF15基因的转录表达。