【摘 要】
:
重性抑郁障碍(Major depressive disorder,MDD)是一项全球性的健康挑战,严重影响着患者的生活质量。由于MDD发病机理复杂多样,并伴有不同的症状,使得临床诊断与治疗较为困难。因此,寻找有效的生物标志物不仅有助于了解MDD的病因,提高MDD的诊断效率,也有助于合理用药提高抗抑郁治疗的效果。本研究的目的在于,使用机器学习的方法建立基于外周血转录标志物的MDD诊断模型和氯胺酮疗效
论文部分内容阅读
重性抑郁障碍(Major depressive disorder,MDD)是一项全球性的健康挑战,严重影响着患者的生活质量。由于MDD发病机理复杂多样,并伴有不同的症状,使得临床诊断与治疗较为困难。因此,寻找有效的生物标志物不仅有助于了解MDD的病因,提高MDD的诊断效率,也有助于合理用药提高抗抑郁治疗的效果。本研究的目的在于,使用机器学习的方法建立基于外周血转录标志物的MDD诊断模型和氯胺酮疗效预测模型。以下内容是本论文两个章节的简要概述。(1)利用机器学习寻找MDD的诊断标志物首先,我们从Gene Expression Omnibus(GEO)数据库中收集了九个表达芯片数据集,每个数据集中都包括MDD患者组和健康对照组。经过一系列质量控制和异质性测试后,来自六项研究的302个样本被纳入meta分析。结果发现了6个在MDD患者和健康对照之间差异表达的基因(FDR<0.05),它们分别为AKR1C3,ARG1,KLRB1,MAFG,TPST1和WWC3。接受者操作特征曲线(Receiver operating characteristic curve,ROC)分析用于评估单个基因的诊断效力,这六个基因的曲线下面积(Area under curve,AUC)分别为0.63±0.04、0.65±0.07、0.70±0.11、0.64±0.08、0.68±0.07和0.62±0.09。为了获得更好的诊断模型,我们采用支持向量机(Support vector machine,SVM)、随机森林(Random forest,RF)、k最邻近算法(k-nearest neighbors,k NN)和朴素贝叶斯(Naive Bayesian,NB)这四种机器学习算法构建模型,得到的AUC分别为0.84±0.09、0.81±0.10、0.73±0.11和0.83±0.09。我们使用其中分类效果最好的SVM构建MDD诊断模型。最终的SVM模型能够较好地区分MDD样本和健康对照样本,并在独立数据集中对该模型的诊断效果进行验证,得到的AUC为0.78。(2)利用机器学习寻找预测氯胺酮疗效的标志物我们对83名难治性抑郁症(Treatment-resistant depression,TRD)患者进行为期两周共6次氯胺酮静脉注射治疗,并记录受试者的汉密尔顿抑郁(Hamilton depression scale,HAMD)量表评分。在基线时,采集受试者全血样品,进行RNA全转录组测序分析。根据基线转录组数据,我们建立包含15个特征基因的SVM模型用于预测氯胺酮治疗反应。该模型在训练样本中的AUC高达到0.96,准确率为93.1%,在验证样本中的AUC为0.8,准确率为81.8%。综上,本研究通过机器学习的方法找到了可靠一致的MDD诊断标志物和预测氯胺酮疗效的标志物,该研究为寻找复杂精神类疾病的潜在生物标志物提供了新见解。基于这些生物标志物构建的SVM模型有望成为MDD诊断和治疗预测的新方法。
其他文献
飞机舵机电动伺服系统是一种实验室半实物仿真设备,可以用于模拟舵机在飞机飞行时所受的复杂力载荷,在舵机性能检测中有着重要作用。由于系统采用被动式力矩加载方式,舵机的位置变化会产生多余力矩干扰,严重影响加载效果。除此之外,时刻存在摩擦干扰力矩也会对加载效果产生不利影响。因此,如何抑制多余力矩及摩擦干扰力矩,最大程度地提升系统加载性能,成为研究飞机舵机电动伺服系统的关键技术问题。论文在国内外飞机舵机电动
换热器作为一种能够实现热量传递的重要设备,被广泛应用于各个工业部门。提高换热器的换热效率,合理地组织其热交换过程,对于有效利用能源和节约能源有着十分重要的意义。因此,本文以板式换热器的内部传热机理为基础,通过探讨其动态换热特性,对出口工质温度的控制问题进行研究,以保障生产过程安全顺利地进行,达到减少能源浪费的目的。首先,针对目前换热器模型精度不够,无法正确反映实际换热过程的问题,将水蒸气加热化学工
目的:由于纵向色像差,不同波长色光在眼内经屈光折射后焦距不同,能刺激出不同大小的调节反应。视频终端显示器上静态混合色光相当于不同波长单色光的叠加,产生冲突的调节刺激;频闪色光指不同波长色光以一定频率交替闪烁,能产生波动的调节刺激。本研究比较静态色光和频闪色光对近视眼和正视眼调节波动的影响,探究静态色光、频闪色光、调节波动和近视发生发展之间可能的关系。方法:22-30岁受试41例,其中近视者22例,
目前,机场主要依靠火力发电来为其用电设备供应电能,造成碳排放量增多,环境污染日益严重,为了改善这一局面,可将光伏发电技术应用到机场建设中,既可促进机场节能减排,减少环境污染,也能降低其运维成本,一定程度上对促进我国航空业持续、快速发展有深远意义。本文以机场离网光伏发电系统为研究对象,为提升光伏发电效率以及平抑光伏输出功率和负载功率波动,对光伏阵列最大功率点跟踪控制、蓄电池储能控制以及直流逆变控制进
蛋白酶体抑制剂硼替佐米(Bortezomib,BTZ)是目前批准用于多发性骨髓瘤初治、难治/复发及维持治疗的一线药物。然而,BTZ有明显的外周神经毒性,会诱发外周神经病变,发生率高达40-60%。硼替佐米诱导的外周神经病变(bortezomib-induced peripheral neuropathy,BIPN)以神经病理性疼痛为主要特征,已成为临床上BTZ减量甚至停药的主要原因之一,严重影响患
在绿色民用航空的发展背景下,政府考虑到经济成本和环境成本问题,呼吁各大机场在飞机短停或过站时使用地面空调代替机载APU(Auxiliary Power Unit)为飞机客舱降温或通风。有研究表明,使用地面空调为飞机客舱送风时,与使用机载APU相比,能耗大幅度降低,同时还降低了噪声和空气污染物的排放,能够在很大程度上实现节能减排的目的。随着民航业的发展,航空公司之间的竞争压力逐渐增大,很多航空公司为
随着技术的发展,机载电路板呈现复杂化、小型化的趋势,由于外界技术封锁等原因,传统基于运行机理的故障检测方法并不完全适用于机载电路板。且仪表检测容易对精密的机载电路板造成二次故障。针对此问题,本文提出了一种基于红外图像的电路板故障诊断方法,利用热像仪对电路板进行无损检测并提取元器件温度数据进行故障诊断,该方法具有通用性强、成本低以及检测难度小的优点。首先,选定实验电路板,设计实验周期和故障模式,设计
目的:分析同种异基因造血干细胞移植术后眼部慢性移植物抗宿主病患者的干眼症的临床特征和相关性分析,为该病的进一步研究和防治策略提供科学依据。方法:利用干眼分析仪、干眼调查问卷和眼前段照相等仪器全面检查和评估在浙江大学医学院附属第一医院接受allo-HSCT手术,并术后于2020年9月至2021年2月在眼科门诊就诊的患者,记录患者睑板腺检查、干眼基本检查(眼表疾病指数、泪膜破裂时间、基础泪液分泌时间、
随着国民经济的发展,民航旅客运输量迅速增长,人工客服的工作面临着巨大压力。旅客出行时常遇到与出行相关的问题,如果得不到及时的答复,将会影响出行满意度,甚至影响旅客行程。伴随着人工智能时代及大数据世代的到来,民航出行问答系统将有助于缓解人工客服的压力。问答系统中,对用户意图的准确识别,将影响后续数据集搜索、答案提取的准确度及效率。与面向开放领域的问答系统不同,民航出行问答系统属于限定领域问答系统,其
起落架系统在飞机地面停放、滑行及起降中起着重要作用,起落架系统故障会严重威胁飞行安全,在总装测试及日常维护过程中都需要对起落架系统进行测试以保证其功能完整性。随着飞机系统集成程度越来越高,各系统间交联关系越来越复杂,总装测试技术逐步向分布式、模块化及智能化方向发展。所以进行飞机起落架模块化测试系统的研究,对于提高起落架系统测试效率具有重要意义。本课题以某型飞机起落架系统为研究对象。首先,围绕起落架