基于中国高新技术、生物科学的迅速发展,中国高新生物制药公司明显上升,同时市场竞争也加剧。现如今,公司内部的争夺早已不仅仅局限于资本、技术的争夺,而逐渐演变成为人才的竞争。员工管理系统作为现代企业人力资源管理的主要部分,同时也是提升公司管理能力的一种关键管理手段。近些年来,随着现代企业管理质量的不断更新与完善,绩效考核逐渐引起更多企业家与管理工作者的高度重视。但在执行绩效管理流程中,常常会发生形形色色的事情,导致管理功能无法得到充分发挥。本文将A合资公司员工的绩效考核体系为主要调研对象,以双因素理论、需求层次理论、公平理论为指导,并与公司多年人力资源管理工作经验相结合,采取了问卷调查法,访谈法调查发现公司缺乏绩效培训与宣贯、考核指标的设计不合理等问题,分析得出公司管理缺乏绩效文化、不能正确认识绩效考核的作用等原因。客观研究了A合资公司的员工绩效考核管理现状,并根据其出现的问题通过改进、重构对员工绩效考核管理体系的严格执行,全面优化和改善A合资公司的员工绩效考核内部管理体系。根据公司的发展目标层次划分:高管员工采取BSC考核法,中层员工采取目标考核法和KPI考核指标法相结的综合考核法,而基层人员则采取KPI考核指标法和360°绩效考核法相结合的考核法;外籍员工采用KPI考核法,公司高管应重视和监督,以期为公司发展起到推动作用。本文的研究内容对A合资公司变革绩效考核体系,提高公司管理水平,提升组织核心竞争力,增强市场竞争力,从而尽快完成公司的战略目标,推动其长远、长期健康发展等方面有着重要意义。