牙鲆(Paralichthys olivaceus)激活素基因两种β亚基的克隆与表达分析

来源 :中国海洋大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:a5823869
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
Activin(ACT),为激活素,属于转化生长因子β(TGF-β)家族成员,由两个β亚基构成,为一种糖蛋白激素,是作用于下丘脑-垂体-性腺轴的(HPG)关键分子。可以调控垂体类激素的分泌和卵巢中类固醇类激素的产生和卵母细胞的成熟。牙鲆(Paralichthys olivaceus)是一种重要的经济鱼类,具有生长快等优点。本文克隆了牙鲆ActivinβA和βB亚基的全长序列,并进行了序列特征分析和表达分析。通过染色体步移技术获得ActivinβA和βB亚基启动子序列,并构建了重组原核表达质粒,实现IPTG诱导表达,为进一步研究Activin的生物学功能及为Activin在生产实践上的应用奠定了基础。(1)本研究通过克隆和RACE(Rapid amplification of cDNAends)技术获得了牙鲆ActivinβA和βB亚基全长cDNA,通过生物软件分别对其进行预测分析,并利用实时荧光定量技术对这些基因在不同组织及发育时期的时空表达进行了研究。A.牙鲆ActivinβAcDNA序列全长1633bp,ORF为1365bp,包括30bp的5′UTR和238bp的3′UTR。通过软件预测,该基因编码了一个含有454个氨基酸的蛋白质前体,分子量为49.9kD,等电点为8.26。在该蛋白的N末端包含一个由20个氨基酸残基组成的信号肽。qPCR结果显示,ActivinβA在牙鲆成体的10种组织中均有表达,其中在全脑、鳃和卵巢组织中表达量最高。B.牙鲆ActivinβBcDNA序列全长1783bp,ORF为1173bp,包括121bp的5′UTR和489bp的3′UTR。通过软件预测,该基因编码了一个含有390个氨基酸的蛋白质前体,分子量为43.8kD,等电点为7.81。在该蛋白的N末端包含一个由22个氨基酸残基组成的信号肽。qPCR结果显示,ActivinβB在牙鲆成体的10种组织中均有表达,其中在卵巢组织中表达量最高。通过软件预测发现牙鲆2种Activinβ亚基都属于分泌型的蛋白,氨基酸序列比对分析表明以上预测出的Activinβ亚基氨基酸序列与其他硬骨鱼类的相似性均较高,显示出硬骨鱼类的Activinβ亚基在进化中的高度保守性。(2)利用染色体步移(Genome walking)的方法克隆了牙鲆Activin基因两个β亚基的上游部分启动子序列,长度分别约为2.7kb和2.4kb,并对克隆的启动子序列进行了转录调控元件的生物信息学预测分析。在预测的Activin βB转录起始位点(+1位)的上游31bp处有1个典型的TATAbox,而在ActivinβA中未发现TATAbox的存在。两个基因的启动子上发现了多个转录因子Sp1、Oct-1、C/EBP、CREB、GATA-1、HNF-3、HNF-1、USF等结合位点,还发现了与内分泌相关的Pit-1、ER、PR、GR、RAR、RXR等结合位点,但肌性转录因子MyoD、myogenin和雄性的性别决定基因SRY结合位点仅在Activin βA启动子中发现。生物信息学分析显示,牙鲆Activin βA和βB表达受到多种潜在因子的调控,两者在调控上有所差异。(3)构建了牙鲆ActivinβA和βB的大肠杆菌表达系统:以pET32a(+)为表达质粒,将ActivinβA和βBcDNA序列(去掉编码信号肽部分的序列)插入其中构建了重组质粒,并在BL21(DE3)pLysS中得到了高水平表达。为进一步从分子水平研究Activin的功能奠定了基础。
其他文献
氯化钾是重要的钾盐资源,应用范围十分广泛,其产品主要分为农业用氯化钾和工业用氯化钾两大类。工业方面,氯化钾可以作为制造其它钾盐的原料,同时是制造焰火、火药等的重要原
山东省青岛市的张治兵,有17个大棚,一个大棚就能3个月净赚近30万元。可每晚6点到晚上9点的3个小时,对张治兵来说极为重要。只要每天这3个小时里稍有疏忽,500多万元就瞬间化为
海洋固氮作用是海洋固氮生物(主要是固氮蓝藻)将惰性的氮气转化成生物可利用的氮的过程。固氮过程主要发生在低纬度寡营养海域的真光层中,并支撑了其将近一半的新生产力。通常认为固氮自养蓝藻(光合固氮)受光照和寡营养盐的控制,然而对于一些非蓝藻固氮生物,则不受到光和营养盐的限制(异养固氮),广泛地分布在一些营养盐丰富、黑暗的生态系统,比如沿海上升流区和大洋无光区(黑暗固氮)。这些区域超越了传统上认为固氮作用
学位
利用不锈钢环形采泥器,在胶州湾东北岸跨海大桥下的潮间带泥滩和胶州湾西南的唐岛湾内湾潮间带,沿天然断面选取三个典型站位,现场采取夫扰动沉积物样品;应用先进的实验设备--
右旋糖苷酶是一种专一性水解右旋糖酐内部的α-1,6糖苷键的水解酶,在制糖工业、低分子右旋糖酐的生产以及龋齿防治中具有广阔的应用前景。目前工业用的右旋糖苷酶主要来自陆源的真菌,存在的问题主要是产酶周期较长,在碱性条件下不稳定,储存时间较短。来自海洋细菌的右旋糖苷酶,具有生产周期短、在碱性条件下较稳定等特点,可以很好地解决陆源真菌的这些问题。本文主要对一株试验室保存的海洋氧化节杆菌(Arthrobac