毛白杨低温胁迫相关microRNAs的鉴定及差异表达分析

来源 :北京林业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hongxing35
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毛白杨(Populus tomentosa Carr)是华北地区优良的乡土树种,具有生长迅速、材质优良、抗逆性强、树干高大通直等特点。低温是其生长过程中经常遇到的一种非生物胁迫,严重制约毛白杨的栽种范围。microRNA是一种具有重要生物学功能的非编码小RNA,参与植物生长发育、抵抗非生物胁迫等方面的基因调控。为了探讨microRNAs在毛白杨低温胁迫下的调控机制,我们构建了两个microRNA的cDNA文库,低温胁迫处理(TC)和未处理(NC)。分别是4℃低温胁迫处理8h后取样和未处理材料(25℃)作为对照(control)。经过高通量测序得到了来自33个microRNA家族的144个保守microRNA,以及29个新microRNA(包括其对应的1croRNA*)。并且通过qRT-PCR验证了16个保守microRNA和2个新microRNA及其对应rnicroRNA*在不同低温胁迫处理下的表达量。使用生物信息学方法预测了新microRNA的101个靶基因。这些靶基因都与植物生长和对不同胁迫的抗性相关。本研究初步表明,microRNAs在调控毛白杨对低温胁迫的反应中起着重要作用。
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