抗沉默组蛋白1B(ASF1B)与胰腺癌临床预后和增殖侵袭的关系

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目的:探讨抗沉默组蛋白1B(ASF1B)在肿瘤中的表达情况以及在胰腺癌临床中的作用;探究ASF1B在胰腺正常细胞及癌细胞系中的表达差异及其对SW1990细胞增殖迁移的影响。方法:利用TCGA数据库分析ASF1B在33种肿瘤与其对应的正常组织的表达差异。在TCGA、GEPIA、GEO、KEGG数据库中:提取190例PAAD中每个TCGA样本的生存信息,选择以下几个指标:总生存期(OS)、年龄(age)、TNM分期、grade分级等来研究ASF1B表达与各种癌症患者生存预后的关系。使用Kaplan-Meier方法和log-rank检验对PAAD进行后期Cox单因素和多因素的生存分析(P<0.05),使用R软件包“survminer”和“survival”绘制生存曲线。使用R包“survival”和“forestplot”进行Cox分析,确定ASF1B与生存时间的相关性。采用FDR法调整p值,FDR截断值<0.05。R包“ggpubr”和“limma”用于临床病理相关性分析,绘制森林图等。通过KEGG和GSEA富集分析,探究ASF1B可能参与调节的信号通路,从而预测其影响肿瘤发生发展的方式和路径。体外培养胰腺细胞系,通过q RT-PCR检测、细胞增殖-毒性实验、划痕实验检测ASF1B的表达差异以及对SW1990细胞增殖迁移的影响。结果:1.在TCGA数据库泛癌分析中,ASF1B在膀胱尿路上皮癌(B LCA)、乳腺浸润癌(BRCA)、胰腺癌(PAAD)等24种肿瘤中表达量增高,ASF1B在正常组织的中值表达低于对应的肿瘤组织表达。2.进一步生存分析发现ASF1B表达水平越高,PAAD患者的总生存期(OS)和预后效应越不理想,差异有统计学意义。在PAAD患者中,TN M分期为Ⅳ期(2.45)的ASF1B表达水平高于Ⅰ期(2.30)的表达水平,差异有统计学意义。在胰腺癌肿瘤中,grade分级越高:Ⅰ级2.18,Ⅲ级:2.62,分化程度越差,ASF1B表达水平越高。在单因素和多因素COX分析中,只有ASF1B因子同时作为病人预后等的危险因素(P<0.05)。3.ASF1B在PAAD中的GSEA富集分析六条高相关的通路及其主要调节功能为:KEGG_BASE_EXCISION_REPAIR参与细胞周期中的碱基修复,KEGG_CELL_CYCLE参与调控细胞周期,KEGG_PRIMARY_BILE_ACID_BIOSYNTHESIS参与调控胆汁酸的合成,KEGG_NEUROACTIVE_LIGA ND_RECEPTOR_INTERACTION参与调控神经活性配体受体相互作用,K EGG_PROTEASOME参与调控蛋白酶体,KEGG_CARDIAC_MUSCLE_C ONTRACTION参与调控心脏肌肉收缩。其中效能最强的为KEGG_BASE_EXCISION_REPAIR和KEGG_CELL_CYCLE。4.ASF1B表达量与hsa-mi R-543表达量呈负相关,R=-0.17,P=0.022。5.与HPNE(1.001±0.032)细胞组相比,As PC-1(2.799±0.019,P<0.01)、Bx PC-3(1.363±0.031,P<0.001)、SW1990(5.554±0.021,P<0.01)、PANC-1(2.553±0.032,P<0.01)细胞组中ASF1B m RNA表达显著升高。敲低ASF1B以后,抑制了胰腺癌SW1990细胞的增殖:F(N ormal control)=11.48,P<0.05;F(Negative control)=136.5,P<0.0001;F(ASF1B-sh1)=110.7,P<0.0001;F(ASF1B-sh2)=139.7,P<0.0001,差异均具有统计学意义。敲低ASF1B以后,抑制了胰腺癌SW1990细胞的迁移:差异有统计学意义(F=70.02,P<0.0001);与阴性对照组(80.23±2.375)%的划痕愈合率相比,正常对照组的划痕愈合率为(84.15±41.35)%,P=0.9987,差异无统计学意义;ASF1B-sh1组划痕愈合率为(50.45±3.22)%和ASF1B-sh2组划痕愈合率为为(30.58±1.246)%,二者均显著下降(P<0.0001)。结论:1.ASF1B在多种肿瘤中高表达,是肿瘤发病进程中的一种重要调控因子。2.ASF1B与胰腺癌患者的总生存期、TNM分期、grade分级等显著相关,表达量越高,预后越差、恶行肿瘤分化程度越差;ASF1B是胰腺癌患者临床生存分析的独立预后因子。3.ASF1B在胰腺癌组织和细胞中的表达高于正常胰腺组织和正常胰腺上皮细胞;降低ASF1B表达量后可抑制胰腺癌增殖、迁移,它在胰腺癌的诊治、疗效判断和预后中具有一定的意义。
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