【摘 要】
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人类免疫缺陷病毒（HIV）的转录、逆转录和翻译过程是一个复杂的调控体系,参与调控的包括病毒的长末端重复序列（LTR）以及一系列由细胞和病毒编码的调控因子和酶,HIV基因表达水平的
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人类免疫缺陷病毒（HIV）的转录、逆转录和翻译过程是一个复杂的调控体系,参与调控的包括病毒的长末端重复序列（LTR）以及一系列由细胞和病毒编码的调控因子和酶,HIV基因表达水平的高低取决于调控网络平衡点的移动.参与调控的细胞和病毒蛋白因子包括Tat,TBP,HFIIB,Nef,Vpu,SP1,NF-κB等.在LTR中存在一系列的调控元件例如TATA Bbox,NF-κB结合位点,SP1结合位点,TAR（Trans-activation-responsive）区等.该研究的主要目的是在充分考虑样品采集的地理分布和时间分布合理性的基础上,采用套式PCR的方法获取我国HIV病毒的主要流行株A,B,E,C,尤其是B/C重组株的LTR区序列,采用序列分析和计算机模拟技术,对LTR区基因变异的基本规律进行研究.该研究对中国HIV主要流行株的LTR调节区的主要顺式调控位点和TAR RNA的一级结构变异规律进行了分析,采用RNA二级结构预测软件对TAR区二级结构进行了预测和比较,并且使用转录因子分析工具对几个重要的转录因子尤其是NF-κB的作用位点进行了分析.在该研究中,对中国流行株LTR的调节区以及TAR区的一级结构和二级结构变异进行了较为系统的分析和总结,并与国际流行株进行了比较.
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