绿色壁垒是近年来在全球环境保护与贸易保护的大背景下产生的一种新型贸易壁垒。我们该如何应对绿色壁垒呢?本文在学界已有研究成果的基础上，首次明确提出了以行政指导为主应对绿色壁垒的观点，并就构建应对绿色壁垒的环境行政指导制度体系及其运行模式进行了初步的探索。 本文第一部分对绿色壁垒进行了法律上的探析，提出了广义的绿色壁垒实质为一系列绿色保障措施，狭义的绿色壁垒实质为一种违法措施的观点，还初步分析了绿色壁垒问题上的“发展中国家悖论”。第二部分对学界业已提出的绿色壁垒应对策略进行了系统的归纳与总结，并分析了引入行政指导应对绿色壁垒的必要性与可行性。第三部分概要地介绍了行政指导的概念、特征，理论、思想基础，比较法研究及其法律责任与法律救济。第四部分初步探索构建了以审议会制度、政府预警机制、外贸协调会、环境标准引导、财政金融支持政策为主要内容的应对绿色壁垒的环境行政指导制度体系，并就环境行政指导的主体、程序、法律责任与法律救济进行了探讨。第五部分结合我国的立法实践和具体国情，分析了环境行政指导的法律依据渊源及其运行模式。