卫河流域水利工程是卫河防洪中十分重要的防洪基础设施，在国家大力发展水利事业的大背景下，逐步形成了数目庞大的水利工程资产，并在不断努力下，初步构建了成规模的防洪工程体系，数量巨大的防洪工程体系为预防水旱灾害，保障国民经济安全，推动工业、农业经济持续、高效、稳定发展，保护水、土资源与生态环境改善等领域都起到了十分重要的作用。新中国成立伊始，卫河逐步形成了以“修、防、管、养”一体化的水利施工管理运营模式，但是运营模式落后、体制不畅、经费短缺等问题日益突显，2006年中旬，卫河流域水管单位遵循我国颁布《水利工程管理体制改革实施意见》相关内容精神要求，基本实现了改革所要求的内容，并基本形成了“管养分离”的水利工程管理运行机制。经过水管体制改革，卫河流域水利工程的面貌得到了巨大的改观，但是，水管单位在进行水利施工管理运营的过程中依然伴随着主体位置不牢固、管理运营机制迟慢、部分工作人员工作认识不够、规章制度不健全、维修养护公司技术能力欠缺、提拔聘用模式不顺畅等情况，严重约束了水利工程管理工作的深度展开，为确保改革精神深度贯彻，明确基层水管单位的职责及要求，确保卫河流域水利及相关堤防工程能够发挥其应有作用，建立并不断完善更加适应社会发展、市场经济体系的水管运行体制机制，促进水利事业科学、健康发展。在水管体制改革的大背景下，本文分析了水管体制改革后，水利工程管理运行机制中所存在的一系列问题，通过研究水利工程管理运行体制中存在的问题，借鉴国内外先进的管理运营模式，结合卫河流域自身特点，研究如何构建卫河流域新型水利工程管理运行机制。