芥菜SSR分子标记鉴定技术体系的建立及应用

来源 :湖南农业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wzmhua
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芥菜(Brassica juncea L.)是原产于中国的特色蔬菜,属于十字花科芸薹属作物。近年来,国内外各高等院校、科研院所及芥菜类蔬菜种业企业新选育的芥菜品种数量不断增加,中国芥菜种子市场上“一品多名”、“一名多品”现象和套牌侵权行为日益严重。因此,建立一套可靠的芥菜品种鉴定技术体系对于规范芥菜种子市场、避免芥菜品种被重复收集和保存、保障芥菜产业健康发展显得尤为重要。本文以搜集到的189份芥菜品种为研究对象,以SSR分子标记为基础,建立了芥菜品种鉴定技术体系及品种DNA指纹数据库,分析189份芥菜品种的遗传多样性以及评价SSR指纹数据库辅助筛选DUS测试近似品种的可行性,旨在为快速鉴定芥菜品种真实性和辅助芥菜品种DUS测试筛选近似品种提供帮助。主要研究结果如下:(1)筛选出25对条带清晰、稳定性好、多态性高的SSR核心引物,该套核心引物PIC值介于0.23~0.86之间,平均为0.493。在189份芥菜品种中共检测到175个等位变异,等位变异的范围为3~21。建立了基于SSR标记的芥菜品种鉴定技术体系,构建了189份芥菜品种的DNA指纹数据库。(2)189个芥菜品种间的遗传距离在0.023~1.00之间,平均值为0.472,UPGMA聚类分析表明,25对核心引物能够将173个芥菜品种区分开,供试品种分为四个类群,其中叶用芥菜分布在各个类群,其遗传多样性高于根、茎和薹用芥菜,基于分子标记的聚类结果与芥菜传统的根据食用部位的分类不完全吻合。此外,不同地理来源芥菜品种之间的遗传多样性结果表明,广东省的芥菜品种遗传多样性较高,从总体分布情况来看,同一省份的芥菜品种大多数聚在一起,地域特征比较明显。(3)利用本研究确定的核心引物对芥菜申请品种及其近似品种进行遗传多样性分析,将已授权的2个申请品种及其近似品种聚在一起,遗传相似度较高。结果表明,基于品种表型性状数据筛选近似品种与基于分子标记的近似品种筛选结果一致。进一步验证了本研究基于25对核心引物构建的189份芥菜品种的DNA指纹数据库,可应用于DUS测试辅助筛选近似品种。
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