自主创新能力是衡量一个国家科技水平高低的关键因素，也是一个国家参与国际竞争的重要砝码。在信息全球化的背景下，一个国家的自主创新实力和科技创新水平决定着这个国家的国际地位。科技政策是影响一个国家的科技发展水平的最大保障,良好的科技政策能促进一个地区科技创新能力的蓬勃发展，并且为自主创新的顺利进行创造良好的环境。本文认为自从改革开放以来，合肥市经济得到了飞速发展，主要受惠于合肥科技政策主管部门颁布的大量激励企业自主创新的科技政策。但是，从科技战略实施的全面来看，科研技术水平大幅度提高需要更为有力的科技政策支撑。我国与西方国家的社会制度虽然不同，但科技政策对企业自主创新的影响都是同样存在的。文章从阐述科技政策与自主创新的相关理论着手，较为详细的分析了科技政策和自主创新之间的关系，以合肥的具体情况为基础，在合理的科技政策指导的原则条件下，运用对比分析、列举分析、文献分析等方法研究合肥市已有的科技政策对高新技术企业自主创新能力的激励作用，针对合肥市科技政策的现状与不足，提出完善科技政策与自主创新之间关系的一些建议对策，从而提高科技政策制定的水平，配合科技兴皖的战略规划，提升合肥市高新技术产业自主创新的能力，使科技政策保持一种合理的张力，确保科技政策在激励企业自主创新过程中的作用。