全球经济高速发展，企业不断涌现，以各种各样的方式影响着社会发展。近年来发生的企业会计造假案，会计信息质量受到各界人士的广泛关注，人们把会计信息质量归结于注册会计师的审计质量。注册会计师的审计质量往往会受到注册会计师的专业胜任能力和审计独立性的共同影响。从近年来发生的审计失败案例来看，许多是注册会计师在各方压力下选择与上市公司合谋产生的造假，这也说明目前我国上市公司还存在审计独立性缺失的情况。审计独立性是注册会计师的核心，失去独立性的会计师即使具有专业胜任能力也难以保证审计结果的客观、公正。审计独立性不仅受到注册会计师的影响，还受到被审计客户的公司特征影响。因此，加强审计独立性需要在提高注册会计师自身素质的同时改善审计执业的外部环境，完善上市公司的治理结构。根据前面学者的研究，审计独立性会受到公司治理结构的影响。公司治理理论的诞生是为了解决公司在发展过程中的经营权和所有权的分离，并且目前已经形成一个成熟的理论体系。由于我国公司发展起步较晚，公司治理理论目前尚处于初级阶段，许多公司治理结构都借鉴西方经验。完善的公司治理结构离不开审计的监督，同时审计行业的健康发展也需要公司治理结构的支持。目前关于公司治理结构与审计独立性的相关影响的研究有很多，有许多问题需要改善。本文以公司治理理论为基础，分析创业板公司治理结构与审计独立性的相关性。通过理论分析和实证研究，分析存在的问题，提出相对应的建议。一方面，我们需要加强创业板的公司治理结构，防止因为治理结构缺陷对审计独立性的负面影响。另一方面，注册会计师需要提高自身素质，促进审计独立性的发展。本文选取创业板上市公司数据作为研究样本，选取了最近两年441个样本数据，然后采用Logistic回归模型对样本进行研究，考虑7个解释变量和2个控制变量。结果表明董事会频率、高层管理人员持股比例、董事长经理两职合一和监事会会议次数与审计独立性显著相关，控制变量资产负债率与审计独立性显著相关，其余变量与审计独立性相关性不显著。最后从完善治理结构、完善审计聘任制度和加强注册会计师管理方面提出建议。