目的:探讨多重PCR检测法在婴幼儿社区获得性肺炎（CAP）病原诊断中的应用价值。方法:回顾性分析2019年9月至2019年12月深圳市儿童医院因CAP住院的3-36月患儿的病原学检测结果。根据患儿使用病原学诊断方法的不同分为多重PCR检测组和传统检测组。其中,利用基于毛细管电泳的多重PCR检测技术检测甲型流感病毒（Flu A）、甲型流感病毒H1N1（Flu A-H1N1）、甲型流感病毒H3N2（Flu A-H3N2）、乙型流感病毒（Flu B）、呼吸道合胞病毒（RSV）、腺病毒（ADV）、副流感病毒（PIV）、偏肺病毒（HMPV）、普通冠状病毒（HCo V）、鼻病毒（HRV）、博卡病毒（HBo V）、肺炎支原体（MP）和衣原体（Ch）的患儿作为多重PCR检测组;而利用呼吸道病毒抗原直接免疫荧光法检测Flu A、Flu B、RSV、ADV、PIV和肺炎支原体荧光定量PCR法检测MP的患儿作为传统检测组。两组根据年龄（±3月）、入院时间（±1周）和标本采样时的病程时间（±1天）按照1:1的比例进行配对,共匹配187对。最后,对两组的检测情况进行比较,并采用SPSS 22.0软件进行统计分析。结果:多重PCR检测组病原总检出率为80.7%（151/187）,明显高于传统检测组（68/187,36.4%）。两组共有病原检测结果比较,多重PCR检测组的检出率明显提高（56.1%vs.36.4%,χ2=14.724,P＜0.001）,其中,多重PCR检测法与呼吸道病毒抗原直接免疫荧光法相比,ADV和RSV的检出率增高有统计学意义（7.5%vs.1.1%,χ2=9.402,P=0.002;12.8%vs.6.4%,χ2=4.426,P=0.035）;与肺炎支原体荧光定量PCR法相比,MP的检出率增高无统计学意义（29.4%vs.27.3%,χ2=0.211,P=0.646）。多重PCR检测结果显示,RSV主要见于3＜12月组,MP主要见于12~36月组,HRV主要见于喘息患儿;2种及2种以上病原的混合感染有45例（占24.06%）,其最常见的病原是HRV,且以HRV和MP的混合感染最多见。结论:多重PCR检测法比抗原直接免疫荧光法更能检测出病原,且检测能力与单引物PCR检测法相似。RSV主要见于3＜12月患儿,MP主要见于12~36月患儿,HRV主要见于喘息患儿。婴幼儿CAP存在混合感染现象,其最常见的病原是HRV,且以HRV和MP的混合感染最常见。