北部湾革囊星虫属资源初探及遗传多样性分析

来源 :广西大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:mryangjinhui
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革囊星虫属(Phascolosoma)是星虫动物门中重要的一个属,其中可口革囊星虫(P.esculenta),也叫弓形革囊星虫,是我国特有的星虫品种,同时也是我国食用星虫的两个主要品种之一,为了了解北部湾地区的革囊星虫资源分布以及革囊星虫自然群体的遗传多样性和遗传结构,本文在2017年10月至2018年2月,分别在广西北海、防城港、广东湛江、海南四必村、越南海防市等北部湾地区对革囊星虫属的资源进行了勘探和采集,共发现三种革囊星虫,分别为可口革囊星虫(P.esculenta)、厥目革囊星虫(P.scolops)和太平洋革囊星虫(P.pucificum)。三种星虫的形态、生境等有较大的差异,我国的革囊星虫主要为可口革囊星虫和厥目革囊星虫,太平洋革囊星虫均采自越南海防市。通过调查分析,对北海革囊星虫资源分布以及密度有一定了解,基于COI基因和16SrRNA基因对北部湾地区的革囊星虫进行序列测定,运用DNAstar、DnaSp5.0、MEGA7.0等基因序列软件对序列进行分析。结果表明:(1).北海半岛的革囊星虫有两种,一种为可口革囊星虫,一种为厥目革囊星虫。两种革囊星虫的形态差异较大,可口革囊星虫的形体较大,介于50-110mm之间,体表有大量褐色的乳突,位于吻基部和身体末端的乳突颜色加深,紧密排列,纵肌束明显;厥目革囊星虫的体型较小介于25-45mm,身体为棕黄色,半透明,纵肌束不明显。太平洋革囊星虫样品采自越南海防市,形体最大,介于60-120mm之间,纵肌束明显,体壁较厚。北海半岛的星虫资源分布区域主要包括金海湾湿地公园、西村港、银滩大桥等半岛东南部的红树林地区,均为可口革囊星虫,其分布密度介于6.24-7.28 ind/m2,生物量为11.48-14.13g/m2,北部湾一号附近的滩涂地也有革囊星虫的分布,为厥目革囊星虫,密度为28.8 ind/m2,生物量为17.86g/m2,分布密度显著大于可口革囊星虫,生物量指数相差不大。(2)通过COI基因以及16SrRNA基因的测序分析,对北部湾地区的三种革囊星虫的基因碱基对、简约信息位点,遗传距离测定、构建NJ树、MP树等结果表明,三种革囊星虫的碱基含量差异不大,A+T含量均大于C+G含量,运用不同的构树方法,其最终结果均表明可口革囊星虫和太平洋革囊星虫的亲缘关系较近,与厥目革囊星虫的亲缘关系较远,其构树结果和通过形态学分类的结果相符合。(3)对不同群体的可口革囊星虫的COI序列碱基对,其中不同群体的碱基含量差异不大,四个地方群体的A+T含量明显大于C+G的含量,A+T含量之和位于59.22-59.55,C+G含量之和为40.45-40.78%之间。符合可口革囊星虫线粒体基因的特点。在80个个体中,共检测出47种单倍型,其中Hap30单倍型在四个群体中均有分布,个体数为12,占总体的15%,其余单倍型随机分布在不同的群落当中。基于Kimura-双参数模型,对不同群体间以及群体内部的可口革囊星虫的遗传距离计算,结果为群体内部的遗传距离为0.0013-0.0028,群体间的最大遗传距离为0.0021,最小的遗传距离为0.0032,群体间与群体内的遗传距离有重叠区域,遗传距离处于同一水平。分子方差分析(AMOVA)结果表明,群体间的遗传变异为1.71%,群体内的遗传变异为98.29%,说明群体遗传变异主要来自群体内部而不是群体间。基于Kimura-双参数模型,对不同群体构建邻接关系树,结果表明47个单倍型之间并没有分出明显的单倍型类群,其节点大部分低于60,没有显示出地域性,不存在地理隔离,可口革囊星虫群体经历过种群扩张事件。
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