在国家863项目"建设合肥网格节点及开发若干典型应用"的支持下,中国科学技术大学国家高性能计算中心、网络中心和科大生命学院分子计算实验室合作开发这个基于网格计算环境的生物计算应用.作为该项目的子项目,我们在科大校园网平台上开发并实现了基于网格环境的蛋白质折叠分子动力学模拟分布式计算.在该项目中,我们开展了以下研究:利用当前网格计算和服务最新技术Web Service和Grid Service,设计并实现了基于网格计算环境的蛋白质折叠模拟的分布式计算模型,在生物计算领域有着重要的应用价值.同时,它整合了当前先进的网络计算技术,在算法上和平台建设上有着广泛的指导和示范意义.研究设计了应用程序调度代理,它的主要功能就是根据网格系统中现有资源的可利用情况和当前请求作业的应用需求特点,确定作业分解、任务/资源分配的最佳方案.细致而有效的应用调度器是让网格资源为应用程序提供良好执行性能的必要保证.这些工具在国外已经有了一些成功的经验,但在国内还是刚刚起步,很多东西需要进一步的研究.因为时间和项目进展的关系,这里只是给出了一个应用调度器的结构模型,这是建立在我们所开发的具体应用上的,具有相当的应用价值和理论意义,同时也具有一定的创新性.当然,对它的具体实现和验证还有更多细致的工作要做.