基于老鼠免疫抑制数据的基因主效应及交互效应分析

来源 :黑龙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:congyuantao
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现代生物技术面临着一个巨大的挑战,即如何提出一个行之有效、计算可行的处理高维数据的方法,问题大多集中在处理基因之间的交互效应上.传统的方法受到算法的复杂程度,软件计算能力等方面的限制不再适用.因此,提出一个切实可行的统计方法势在必行.本文主要研究老鼠群体对紫外线辐射引起的免疫抑制易感性基因间的主效应及交互效应.首先,我们利用筛选清理(Screen and Clean)和Dantzig变量选择的方法筛选数据变量,建立合理模型,分析位点间的主效应及交互效应.比较两种方法检测的显著位点之间的区别,并评价两种方法的优缺点.结果显示Dantzig变量选择的方法较前者准确度更高.其次,结合Dantzig变量选择方法提出两阶段法,在全基因组范围内检测老鼠群体的与紫外线辐射引起免疫抑制易感性有关的性状之间的主效应及交互效应.最后,分析总结所应用的方法,识别出主效应显著性强烈的位点是D10Mit170,交互效应显著的位点对是D14Mit266和D19Mit34.
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