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染色质共价修饰是调节基因转录的重要因素，其中组蛋白H3K4甲基化被认为在转录激活和转录延伸中起正调控作用。近年有研究发现H3K4甲基化参与了转录抑制调控，但作用机制仍不是很清楚。本文中，以PH05基因为模型研究H3K4甲基化抑制基因转录的机制。研究发现不管在转录抑制还是激活的状态下，PH05基因的启动子区都存在高水平的H3K4甲基化，H3K4甲基化的缺失导致PH05在抑制状态下的本底转录增多，而对诱导过程影响不大。发现H3K4甲基化不影响特异性转录因子Ph02和Ph04在PH05启动子区的结合，但H3K4甲基化缺失会导致PH05基因启动子区核小体的松散，进而导致转录共调节因子的结合增多，从而激活PH05的转录。进一步的研究发现组蛋白去乙酰化酶Rpd3L复合物中的两个亚基Cti6和Ph023能够通过它们的PHD结构域，将整个复合物招募到PH05基因启动子区，并实施去乙酰化作用。甲基化的H3K4抑制PH05基因启动子区核小体松散的作用需要通过招募Rpd3L而使组蛋白H3去乙酰化来实现。实验结果揭示了H3K4甲基化通过招募去乙酰化酶稳定核小体从而抑制转录的新机制。