非营利科研机构作为一个新的组织形式在中国才刚刚开始,其管理制度尚处于探索阶段.作为水利部四大非营利科研机构之一的长江科学院,非营利事业即公益性科研是其今后工作的主要任务,进行长科院非营利事业发展战略的研究,对正确处理营利部分与非营利部分的关系,共同构建发展的平台,促进长科院非营利和营利部分的协调发展具有重要的现实意义.论文以国家科技体制改革政策为指导,首先介绍了论文分析的理论基础和方法,定义了非营利科研机构、公益性科研的概念,描述了长科院公益性科研的实践,在分析长科院面临的内外环境的过程中,采用迈克尔·波特的五种力量分析模型,重点分析了现阶段长科院的行业竞争状况,指出现有组织间的竞争及购买者的力量,对长科院的威胁程度较大,决策者应引起高度重视和利用;论文进一步总结找出机会威胁、优势劣势关键因素,建立外部因素评价矩阵(EFE)、内部因素评价矩阵(IFE),为制定战略打下基础;随后运用SWOT分析法得到备选战略,通过问卷调查、专家打分法收集各种意见,采用模糊综合评判的方法,选择合适的发展战略,得出了制定长科院非营利事业发展战略,必须把非营利、综合事业和科技企业作为一个整体一并考虑,三位一体协调发展是长科院过渡期非营利事业的发展目标,指出了高层次人才缺乏、调整结构和机制完善是非营利发展目标的核心环节.作为实现目标的保障,论文设计了非营利、综合事业、科技企业分线管理的思想,研究了相应的组织结构,在借鉴发达国家非营利科研机构及其管理,并结合中国国情的基础上,对非营利运行机制和管理制度进行了研究.研究结果对长科院非营利事业的发展有直接的指导作用,对国内非营利科技机构也有一定的参考价值.