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水稻是黑龙江省主要粮食作物，稻瘟病是影响寒区水稻生产的限制因子之一。黑龙江水稻品种抗稻瘟病性差的主要原因，一是抗稻瘟病育种遗传资源狭窄：二是水稻育种基本上是常规育种，不能有效、快速、准确利用籼稻种质资源中抗稻瘟病基因。Pil和Pi2是籼稻中广谱、显性的主效抗稻瘟病性基因。为了将Pil和Pi2基因导入黑龙江水稻基因组中，本研究利用分子标记辅助选择(MAS)的方法，以BL6为供体亲本，以黑龙江水稻主栽品种空育131为受体亲本，培育寒区水稻品系空育131(Pil/Pi2)。为此，首先筛选了受体亲本和供体亲本的前景选择和背景选择SSR分子标记的多态性。同时，受体亲本和供体亲本杂交获得了F1代，并利用SSR分子标记鉴定了F1杂种的真伪。然后以真F1杂种为母本，和受体亲本空育131回交，对回交BC1F1群体进行了分子标记辅助的前景选择和背景选择，并对入选的植株进行了人工接种的抗稻瘟病性鉴定。本研究主要结果如下：
1.筛选到了双亲间具有多态性的、与Pi1及Pi2基因紧密连锁的SSR分子标记RM144和AP22。RM144和AP22可以作为MAS技术培育水稻品系空育131(Pil/Pi2)前景选择的DNA分子标记。
2.筛选到了24个可以做为培育水稻品系空育131(Pil/Pi2)背景选择的SSR分子标记。
3.实施了受体亲本和供体亲本的有性杂交工作，利用AP22标记从F1群体中鉴别出了真杂种。用真杂种做母本，和空育131回交，获得了BC1F1。
4.对BC1F1群体植株进行了前景选择和背景选择，获得了具有Pil和Pi2基因、遗传背景恢复到空育131基因组70％左右、抗寒区稻瘟病菌的水稻材料。