改革开放以来，经济高速增长的同时，资源短缺和环境污染等问题也不期而至。为了构建绿色中国、实现中华民族伟大复兴和可持续发展，我国政府坚持资源节约和环境保护等基本国策的同时，高度重视新能源研究与开发，将生态文明建设提高到与政治建设、经济建设、文化建设同等重要的地位。　　针对新能源等产业的发展，国家发改委、财政部、科技部等23个部委于2015年3月16日召开的战略性新兴产业发展的部际联席会议中明确指出：新能源产业、节能环保产业、新能源汽车产业等七大产业已成为我国重点培育的战略新兴产业。国家加大在这些产业上的财政资金投入力度，在税收、补贴等方面支持新能源产业、新能源汽车产业的发展。随着我国财政专项资金投入的额度不断增加，一些领域出现了不太喜人的消息：涉农专项资金的套取、新能源汽车恶意骗取补贴资金等一系列问题，因此对专项资金进行审计，显得格外重要。对新能源汽车补贴专项资金进行审计，不仅能够对投入到新能源汽车产业的资金落实情况进行监督，对促进能源结构调整、加快科技成果转化、增强自主创新能力、推动经济又好又快的发展也有着不可替换的作用，而且能够拓展我国财政专项资金审计研究的领域。　　本文基于委托代理理论和可持续发展理论对新能源汽车补贴专项资金进行可行性分析，梳理相关文献、借鉴其他专项资金审计理论研究。以新能源汽车补贴中最为典型的吉姆西为例，首先根据新能源汽车补贴专项资金管理现状和审计目标、审计内容对目标企业进行审计，针对审计中发现的问题进行整理归纳；其次，在上述归纳的基础上，分析新能源汽车补贴专项资金管理存在问题的原因，而后尝试构建一套包含准入审核、事中监督、事后追踪的机制，建议从新能源汽车补贴的申请、拨付、使用等环节加入审计力量。最后对审计计划、审计组织方式和方法等方面工作提出了完善建议，比如：从专项资金的资金链全环节开展审计、加大针对性培训及加强审计资源配置、注重多种审计方法开拓并用。希望可以为以后开展同类专项资金的审计提供借鉴。