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水稻是世界上最主要的粮食作物之一,水稻杂种优势利用使得水稻产量大幅度提高。我国的杂交稻种植面积占总种植面积的一半,而杂交粳稻仅占杂交稻的5%,有很大的发展空间。目前我国最广泛应用的三系杂交制种中的不育系为BT型不育系,在杂交制种过程中,不育系的包颈现象是限制制种产量的一个重要因素,目前生产上是通过施用赤霉素来解决包颈、提高异交结实率问题的。选育长穗颈材料,减少或免去赤霉素的施用,对于降低杂种种子生产成本具有重要的价值。为此,本研究利用生产上大面积应用的籼稻保持系Ⅱ-32B为受体亲本,长穗颈的粳稻地方品种A7444为供体亲本构建的染色体片段置换系(Chromosome segment substitution lines,CSSL)群体,在2014年、2015年和2016年3个年份环境下调查了穗颈长度表型值,结合该群体SSR标记基因型数据,运用QTL IciMapping4.0软件,检测了水稻穗颈长度QTL。同时为了筛选与穗颈长度相关但不影响株高的位点,还利用该群体对株高性状也进行了 QTL研究。获得的主要研究结果分述如下。1.穗颈长度性状,3个环境下共检测到了 9个QTL,分布在第1(2个QTL)、第3(2个QTL)、第8、第10(2个QTL)、第11和第12号染色体上,对表型的贡献率的范围为6.1%～50.18%。其中qPNL1.2、qPNL8和qPNL10.1三个位点的加性等位基因来自受体亲本;其余位点加性等位基因均来自供体亲本,加性效应值范围在2.15cm～6.47cm之间。qPNL1.如和qPNL10在三个环境下均被检测到,其中qPNL1.1位点不同环境下解释表型变异的17.84%～34.05%;qPNL10解释表型变异的24.80%～50.18%。qPNL1.2在2014年和2015年两个环境中被检测到,贡献率分别为18.92%和17.51%,加性效应值分别为3.87cm和3.41cm。2.株高性状,3年环境下共检测到4个QTL,分别分布在第1、第3、第6和第12号染色体上,对表型的贡献率的范围为8.45%～59.05%。qPH12位点的增效等位基因来自Ⅱ-32B,加性效应值为17.45cm;其余位点的增效等位基因均来自A7444,加性效应值范围为6.91cm～26.22cm。位点gPH1在3个环境中均被检测到,解释表型变异的30.27%～59.05%;位点qPH3在两个环境中被检测到,解释表型变异的8.45%～9.54%。3.发现3个位点具有多效性。在RM1246、RM6696和RM3564标记位点处A7444的等位基因可同时增加株高和穗颈长度,RM1246标记位点只在一年中检测到。本研究中检测到的株高和穗颈长度数量性状位点可为穗颈长度性状的遗传改良提供分子标记信息。