自2008年金融危机以来，商业银行的风险管理越来越受重视，而且，随着金融市场的开放，银行业竞争的加大，提高商业银行绩效的问题也成为管理者进行商业银行管理的重点。长期以来，众多学者研究分析影响风险的因素或是研究影响银行绩效的因素。考虑到我国商业银行所面临的机遇与挑战，为了让其更好的迎接机遇接受挑战，本文认为，在对商业银行进行经营管理的时候，同时考虑风险及绩效的问题是趋势所在。因此，本文基于商业银行资本结构及经营效率两个方面，分别分析对银行稳定性及绩效的影响及他们间关系。本文以我国2000年到2012年21家商业银行为样本面板数据，建立稳定性评价体系衡量商业银行稳定性大小，所得值越大，银行越稳定。然后分别建立稳定性-资本结构绩效固定效应模型和稳定性-经营效率绩效固定效应模型。通过回归分析发现，第一个模型仅核心资本充足率，资产收益率和资产结构比率与银行破产风险显著相关，除了核心资本充足率与稳定性负相关，其余两个变量均与稳定性呈正相关。即保持银行经营绩效，负债比率不变时，可以通过优化资本结构来提高银行稳定性水平。而第二个模型显示代表经营效率的综合效率和表示边际技术效率的技术效率的一阶差分，以及表示商业银行资产规模大小的总资产的弹性均与商业银行稳定性水平正相关，即在银行经营绩效不变的情况下，可以通过提高银行的综合效率和边际技术效率来提高该商业银行的稳定性。根据文献分析及实证分析结论，本文针对商业银行管理提出以下几个建议：（1）加大加强商业银行的技术改革而不是制度改革，特别是边际技术效率的提高。（2）加强金融市场的管理，特别是银行风险的管理，完善相应风险管理制度，科学化技术化重视我国现代商业银行的风险管理。（3）多与国外先进发达国家银行进行沟通交流与学习，特别是在提高银行综合效率，经营管理上，最终让我国商业银行在世界银行界以先进的经营管理而占据领先位置，而不是仅仅体现在资产规模上。