中国汉族人过敏性紫癜MHC区域精细定位研究

来源 :安徽医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:shaodongjia1668
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
研究背景过敏性紫癜(Henoch-Sch(?)nlein purpura,HSP)现又称Ig A血管炎,系以Ig A1免疫复合物广泛沉积于毛细血管、小动脉、小静脉为主要特征的自身免疫性血管炎,多数预后良好且呈自限性,2-10岁儿童为好发人群,成人相对少见。过敏性紫癜在儿童年发病率约3-26,7/100.000,成人约0.8-1.8/100.000,男多于女。过敏性紫癜最突出的临床表现为通常分布在下肢为主的非血小板减少性皮肤紫癜,除此之外关节症状(关节肿痛)、消化道症状(腹痛、便血)、肾脏受累(血尿、蛋白尿),少数患者可累及心、肺等重要脏器。根据受累部位及临床表现,HSP可分为五种亚型:单纯型、腹型、关节型、肾型、混合型,目前观点认为肾脏受累常与预后不良相关。过敏性紫癜发病机制至今仍未完全阐明,亚洲人群相较高加索人群更高的发病率、患者一级亲属发病风险显著升高以及家族聚集发病现象均提示过敏性紫癜具有较强遗传背景,而病原微生物感染、蚊虫叮咬、药物、疫苗接种及食物等目前均被认为与诱发疾病密切相关。上述现象表明遗传和环境因素共同作用所致的自身免疫系统紊乱可能在疾病发生发展过程中发挥重要作用。位于人类主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complex,MHC)区域的人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen,HLA)基因目前被认为是与HSP发病最密切相关的基因之一,基于传统候选基因法所获得的一系列研究结果已提示多个HLA等位基因与HSP发病密切相关。由于候选基因法存在一定局限性,为了寻找中国汉族人群HSP患者HLA区域易感基因,我们首次在中国汉族人群HSP患者中开展了一个GWAS研究,随后利用Jia等在2013年开发的HLA基因型填补方法(SNP2HLA)参考安徽医科大学皮肤病研究所2016年基于10689正常中国汉族人群基因变异深度测序数据构建的MHC区域数据库对过敏性紫癜患者HLA等位基因及其对应的氨基酸位点与疾病的关系进行研究,为进一步理解HLA基因遗传变异在过敏性紫癜疾病发生中的作用机制打下基础。目的过敏性紫癜为儿童期最常见原发性自身免疫性血管炎亚型,成人亦可发病。由于疾病具有较强的遗传背景,我们在GWAS研究所获得数据基础上参考中国汉族人群特异性MHC区域数据库,利用HLA基因型填补方法对过敏性紫癜患者与对照人群MHC区域进行精细定位研究并进一步探索整个MHC区域遗传变异在中国汉族人群HSP发病中的作用。方法参照样本收集标准,我们先采用Illumina Infinium Global Screening Array chip芯片对514例中国汉族人群HSP患者和7186例健康对照进行全基因组基因分型,经样本及数据质控后提取扩展的MHC区域单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism,SNP)位点分型数据,利用SNP2HLA软件参考新构建的基于10689例中国汉族人群MHC区域参考数据集对MHC区域进行HLA基因型填补,进而研究HLA等位基因、HLA基因对应氨基酸位点及SNPs与HSP间的相关性,并通过对HLA等位基因、HLA基因对应氨基酸位点进行逐步回归分析进一步确定MHC区域内独立HSP易感位点。对发现的MHC区域内易感位点通过可获得详细临床资料的HSP病例,分析患者不同临床表型特征与易感位点间是否存在关联性。结果全基因组基因分型及质控过滤数据后,我们共发现MHC区域17个基因分型的SNPs(rs9275407、rs9275440、rs9275332、rs9275393、rs9275428、rs9275371、rs9275439、rs9275390、rs9275377、rs9272346、rs9275464、rs660895、rs521539、rs9275365、rs17427599、rs9269110、rs9275327)和非MHC区域27个基因分型的SNPs与HSP的关联性达到全基因组显著性水平(P<5×10-8)。随后我们利用新构建的中国汉族人群MHC参考数据集进行HLA基因型填补并对填补后获得的数据进行了质量控制及关联性分析,结果发现132个SNPs、3个HLA对应氨基酸位点(HLA-DRB1 amino acid Asn120,HLA-DRB1 amino acid Ser120,HLA-DRB1 amino acid Val11)达到了P<2.21×10-6的本研究显著性水平,3个HLA等位基因(HLA-DRB1*04,HLA-DRB1*06,HLA-DRB1*06:02)无限接近本研究显著性水平和,与HSP发病相关。对HLA等位基因及氨基酸位点的进一步逐步回归分析在整个MHC区域发现6个独立HLA等位基因异常信号(HLA-DRB1*04,HLA-DRB1*16,HLA-DRB1*01,HLA-DRB1*12:02,HLA-DRB1*10,HLA-DRB1*15:02)及3个HLA基因氨基酸位点独立异常信号(HLA-DRB1第120,26,96号氨基酸位点)HSP易感位点信号。我们研究中所发现与HSP发病相关异常位点均位于HLA-DRB1基因,未发现MHC区域其他HLA基因异常信号。共216例HSP患者可获得详细临床资料,将HLA-DRB1*04及HLA-DRB1 amino acid Asn120按照纯合子、杂合子及未携带进行分组参照患者年龄(≤10岁,>10岁)、肾脏是否累及、白细胞计数是否正常、中性粒细胞计数是否升高、淋巴细胞计数是否升高、血红蛋白是否降低、血小板计数是否升高、ASO是否升高、补体C3是否降低、补体C4是否降低、CRP是否升高、血清Ig A水平是否升高、血清总Ig E水平是否升高、D-D二聚体是否升高、ESR是否升高进行卡方检验,结果表明HLA-DRB1 amino acid Ser120氨基酸位点纯合型患者与ASO水平异常存在统计学差异(P=0.043),其余临床特征均未发现与上述位点存在统计学差异。结论本研究为首次在中国汉族人群中针对过敏性紫癜开展了全基因组关联分析研究并采用中国汉族人群大样本MHC区域参考数据集通过HLA基因型填补方法进行了进一步的精细定位研究,在整个MHC区域发现了6个HLA-DRB1等位基因及3个HLA-DRB1氨基酸位点异常信号与过敏性紫癜发病密切相关,研究结果提示HSP发病具有高度遗传背景并且在MHC区域与HLA-DRB1基因密切相关,为阐明MHC区域遗传变异在中国汉族人群过敏性紫癜中作用机制奠定了初步理论基础。研究未发现HLA-DRB1相关位点与疾病严重存在显著相关性。
其他文献
急性呼吸窘迫综合征(acute respriatary distress syndrome,ARDS)系临床上常见的一种急危重综合征,病理特征为肺泡上皮和毛细血管内皮的损伤,导致弥漫性的不均一性的肺间质及肺泡水肿,患者临床特征为难以纠正的低氧血症和进行性加重的呼吸窘迫。ARDS患病率在0.01%-0.05%,而死亡率高达40%,是一种严重威胁生命的疾病。ARDS的治疗仍主要为机械通气、严格的容量管
学位
氮杂六元环化合物是一类非常重要的氮杂环化合物,广泛存在于具有生物活性的天然产物中、在农药和医药领域有着巨大的用途,同时也是有机合成中重要的合成砌块,通过简单反应不仅可以将其引入到多官能团化的手性化合物中,还可转化为其他重要杂环化合物,如吲哚、吡咯等杂环骨架化合物。因此,氮杂六元环化合物的构建也是一项极其重要的研究课题。硝酮作为有机合成中重要的1,3-偶极子,具有稳定性好、易合成和反应活性高等优点,
学位
恶性肿瘤发生依赖于细胞能量代谢的重新编程,这既是其他致癌因素相互作用的直接后果,也可能是导致其他肿瘤特征产生的主要原因。肿瘤细胞新陈代谢的一个共同特征是能够从经常缺乏营养的环境中获取必要的营养,并充分利用这些营养物质来维持生存或促进增殖。伴随着肿瘤相关的代谢重编程,细胞内外的代谢物也会产生相应的改变,从而对基因表达、细胞增殖分化及肿瘤微环境产生深远影响。目前关于癌症相关的代谢的研究显主要集中在以下
学位
目的了解孕产妇血清双酚类(bisphenols,BPs)化合物的水平,评估与孕产妇BPs暴露相关的饮食和健康危害。探讨BPs孕期暴露与子代宫内发育受损的相关性,验证“BPs孕期暴露致胎盘炎症介导胎盘屏障、物质交换和内分泌功能不全可能是改变子代宫内发育编程的重要病因”的科学假设。方法采用巢式病例对照设计,孕妇首次前往妇幼保健院接受孕期保健服务时被招募进入队列,并被随访至分娩结束。依据新生儿的性别和分
学位
研究背景肝细胞癌(HCC)是最常见的肝恶性肿瘤,超过80%的肝细胞癌发生于肝硬化患者,提示肝硬化患者是肝癌的主要危险人群。肝硬化、肝癌患者早期症状较隐匿,而相关症状一旦出现,患者往往处于肿瘤晚期,对高危患者进行定期筛查,是提高肝癌检出率的前提。目前美国肝脏疾病研究协会(AASLD)、欧洲肝脏研究协会(EASL)建议对高危人群即6个月一次肝脏B超及AFP筛查。在临床工作中,我们发现根据指南建议,很多
学位
目的(1)评估能谱CT的多物质分离定量(MMD)算法用于测量不同水平肝脏脂肪含量的准确性。(2)探讨在肝脏Fe过载的情况下,能谱CT MMD-fat算法用于测量肝脏脂肪含量的准确性。(3)以MRI的IDEAL-IQ梯度回波测得的质子密度脂肪分数(PDFF)作为参考标准,评价和比较能谱CT MMD-fat算法对非酒精性脂肪肝患者的脂肪分数测量的准确性,以及评估MRI IDEAL-IQ和能谱CT MM
学位
研究背景:脑小血管病(CSVD)是目前最常见的脑血管疾病类型之一,可引起认知、情绪、尿便及步态障碍等一系列临床症状。近年来CSVD引起的运动症状越来越受到关注,步态障碍是CSVD目前仅次于认知障碍的第二大临床特征,严重影响患者的生活质量,显著增加跌倒及致残风险,因此,探讨CSVD步态障碍的发生发展机制具有重要的临床意义。目前关于CSVD患者步态障碍的神经网络机制尚不清楚。既往研究探讨了CSVD患者
学位
目的观察续苓健骨方治疗肾虚血瘀型绝经后骨质疏松症的临床疗效;通过转录组学的研究和体内外实验验证续苓健骨方对IL-17信号通路关键分子IL-17RA、Act1、FOSB的影响以探讨其作用机制。方法1.以肾虚血瘀型绝经后骨质疏松症患者为研究对象,随机分为试验组35例和对照组32例。在口服葡萄糖酸钙片的基础上,试验组给予续苓健骨颗粒,对照组给予骨化三醇胶丸,疗程6个月。记录两组治疗前后的中医证侯积分、骨
学位
背景急性呼吸窘迫综合征(acute respiratory distress syndrome,ARDS)是重症患者发病和死亡的重要原因。ARDS是以肺水肿和急性炎症为特征的一种综合征。目前对于ARDS尚无特效的治疗方法,因此需要新的治疗手段。动物和细胞模型的应用为探索人类疾病的发病机制,疾病的诊断、治疗和预后,确定新的生物标志物以及药物研发发现新的靶点提供了重要的研究基础。脂多糖(lipopol
学位
研究背景频复发(Frequently relapsing,FR)或激素依赖型(Steroid-dependent,SD)肾病综合征(Nephrotic syndrome,NS)遵循复发和缓解过程,需长期激素治疗,常出现副作用,如肥胖、骨质疏松、高血压等,需加免疫抑制剂。临床特征主要为蛋白尿和水肿,可显著影响患儿健康相关的生活质量(Health-related quality of life,HRQ
学位