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本研究从2000年到2002年期间我国部分地区在水禽中流行的H5亚型禽流感毒株中选取了13株鹅、鸭源分离株和1株鹌鹑分离株进行了毒力特性和HA基因序列的研究。 选取了6株鹅源分离株WZ2001、SZ2001、JD2001、WJ2001、SH2000和WJ2000，通过静脉接种35日龄无H5亚型抗体的荣昌鹅，死亡率从20％到100％不等，将这6个毒株分为三个等级：WZ2001的致死率达到100％，SZ2001的致死率达到80％，对鹅的毒力最强；JD2001和WJ2001其次，致死率为66.7％和60％；SH2000致死率为40％，WJ2000致死率仅为20％，对鹅的毒力最弱。观察它们的细胞病变发现各有差异，36小时后WJ2001株在CEF的病变最明显，SH2000株相对较弱。 提取这14个毒株的基因组RNA，利用RT-PCR技术成功的提取它们的基因组RNA，利用RT-PCR技术成功扩增出与预期的1.7kb大小相符合的HA基因特异条带，将扩增产物提纯后克隆入pGEM~R-T载体，进一步进行了序列测定。序列分析表明所扩增的14个毒株HA基因片段长度均为1732bp,包含的完整阅读框架长度为1707bp，共编码568个氨基酸。14个毒株HA裂解位点处均具有多个碱性氨基酸，序列为RIRKKR(WZ2001)、RRRKRR(WJ2001、SZ2001和AN2001 3株)、RRRKKR(其余10株)三种不同的类型，从分子水平显示这14个毒株是高致病力毒株。序列同源性分析结果显示，这14个毒株之间HA基因氨基酸的同源率为96.3％到99.1％。它们与国内早期H5N1亚型分离株GD96、HK97和欧洲代表株IRE83，北美代表株PA83的HA基因氨基酸同源率分别为GD96 96.1％-97.9％，HK97 95.1％-96.8％，IRE83 89.1％-90.9％，PA83 84.6％-86.3％同源性依次降低，说明广阔的地域和长时间分布是病毒流行分布的主要趋势。 比较这14个HPAIV的HA基因上的重要位点：裂解位点、受体结合位点和潜在的糖基化位点发现，其裂解位点和受体结合位点大致相同，WJ2002株在301，511位点，AN2001在757位点处出现了两个潜在的糖基化位点，JD2001在469位点处出现了潜在的糖基化位点，SH2001和DTZool在628位点处有一个糖基化位点消失。 以HA基因编码区序列为基元，对本文所做的14个毒株构建HS亚型月v分离株的遗传发生树。结果表明除WZ2001独立形成一支外，其余13株按分离的时间不同可明显的分成两个分支，而非水禽分离株与和它同期分离的几个Alv毒株不在同一分支上，而是同后期分离的几个毒株同源性较高。由此可提示我们在病毒流行中可能出现这种情况:鹅、鸭，非水禽(如鹤鹑)竺知水禽，而造成在水禽中AI的再次流行。