在我国,创新已然成为这个时代永不褪色的发展主题,党的十八大、十九大提出了建设创新型国家的重要主张。在《中国制造2025》“技术创新带动、质量先行”的政策推动下,中国进入了全新的创新战略发展时代。然而,我国大多数医药企业自发展以来,对自主研发方面的积极性尚有待提高,制药生产业务发展方向多倾向低价低利润参与竞争的仿制药物。自2016年全面深化推进医疗改革,出台了一致性评价、优先评审、集中采购等一系列的政策,打破了我国医药行业中同质化竞争的现状,推动医药企业加快在药品质量、研发等方面的提升与发展,激化了医药行业市场竞争。虽然现阶段国内制药企业在技术创新和新药研发方面取得了突出成绩,但与发达国家水平还相差甚远。医药企业想要在竞争激烈的市场中站稳脚跟,增加研究开发投资、加强技术革新至关重要。因此,对于医药企业、行业和国民经济的发展,研究医药企业的创新投入如何影响公司绩效具有重要意义。在此背景下,首先,总结了国内关于创新投入和公司绩效的研究论文,并初步分析了研发投入对公司绩效的影响机理和有关理论。然后,了解中国医药行业状况,包括研发投入与绩效的总体状况,以初步确定研发投入对公司绩效水平的增长存在促进作用,为下一步的案例研究奠定了基石。之后,再选取恒瑞医药为主要研究对象,根据具体个案的研发投入状况和公司绩效水平进行定量分析,以研究二者之间的相关性。选定恒瑞医药2016年-2020年作为研究区间,运用定性与定量相结合的方法从案例企业研发投入资金、研发强度以及研发人员指标来分析其研发投入现状,在常用的财务指标分析法基础上,加入对企业价值的考虑,使用EVA评价法,而后结合专利申请数量、新产品情况等非财务指标的应用,对被研究企业的财务绩效和创新绩效进行分析。专门分析了恒瑞医药研发投入对公司绩效的影响后,得出以下结论:虽然研发投入对企业不同财务指标的影响不同,但总的来说,研发投入对企业整体财务绩效的提高具有积极推动效果,然而具有一定程度的滞后;研发投入对企业价值（或经济增加值）的提高有着重要推进作用,即二者之间具备一定的相关性;研发投入对企业的创造与产出有显着影响,帮助企业不断突破创新,发布新产品,促进企业形成创新产出良性发展态势。为了更好地推进医药行业创新性与持续性发展,提出了以下建议:第一,加大研发投入,发挥企业自主创新潜力;第二,广纳人才加强培养,提高研发人员整体素质;第三,合理安排研发投资活动,完善科技创新价值评估体系;第四,政府完善相关扶持政策,鼓励创新,优化融资环境。