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【目的】
通过对不同时期带状疱疹患者肠道菌群的丰度和多样性的观察,初步探索带状疱疹与肠道菌群的联系。
【方法】
本研究通过对在2017年12月至2018年12月在深圳市第六人民医院疼痛科住院的35例带状疱疹患者,其中13例发病时间小于等于10天(VZVA),9例发病时间大于10天且小于等于30天(VZVB),13例发病时间大于30天(VZVC)进行研究,同时收集35例健康体检组(N)作为对照组。收集70例研究对象的资料,包括:住院资料、疼痛评分、粪便样品,利用磁珠法对粪便样品的DNA进行提取,在提取到的菌群DNA的基础上进行16SrRNAV4区PCR扩增,并将使用Thermofisher的IonS5TMXL进行上机测序,通过可操作分类单元(OTU)聚类分析及物种注释、α-多样性和β-多样性的结果进行物种组成差异分析和多样性分析。
【结果】
1.与正常健康人相比带状疱疹患者组粪便中细菌菌群物种OTU信息量明显增加(P<0.05),在多样性指数(chao指数、ace指数及observedSpecies指数)比较中正常组与患者组中存在显著差异(P<0.05),患者组多样性及丰度高于正常组。
2.在物种结构占比分析中,正常健康组与患者组相比,患者组中Bifidobacterium(乳酸杆菌)、Lactobacillus(双歧杆菌)的占比较正常组低,致病菌Actinobacteria(放线菌)、Fusobacteria(梭杆菌)占比较高。
3.组间的差异物种在门水平上VZVA与VZVB组之间差异物种为Fusobacteria(梭杆菌门),VZVA与VZVC组之间差异物种为Firmicutes(厚壁菌门)、Bacteroidetes(拟杆菌门),在科的水平上正常对照组与患者组出现差异菌群,正常组N与VZVB组和VZVC组差异菌均为Veillonellacea(韦荣球菌科)、Alcaligenaceae(产碱杆菌科),患者组中VZVA与VZVB组之间差异菌为Fusobacteriaceae,患者组中VZVA与VZVC组之间差异菌为Bacteroidaceae(拟杆菌科)、Lachnospiraceae(毛螺菌科),在属水平上,患者组与正常组之间有Parasutterella(副萨特氏菌属),unidentified_Ruminococcaceae,Megamonas(巨单胞菌属),Lachnoclostridium,Collinsella(柯林斯氏菌),等属群有差异,患者组(VZVA、VZVB、VZVC)两两组之间亦存在差异菌属(P<0.05)。
4.PCoA分析患者组(VZVA,VZVB,VZVC)肠道菌群可明显区分于正常健康组(N),表明正常健康组与患者组结构存在差异。
【结论】
带状疱疹患者肠道菌群与正常健康人相比,菌群多样性指数存在明显差异,带状疱疹患者肠道菌群多样性高于健康者;早期带状疱疹患者中益生菌较正常组占比少,早期带状疱疹患者中致病菌如放线菌、链球菌比例升高,乳酸杆菌、双歧杆菌等益生菌占比较健康者低。
通过对不同时期带状疱疹患者肠道菌群的丰度和多样性的观察,初步探索带状疱疹与肠道菌群的联系。
【方法】
本研究通过对在2017年12月至2018年12月在深圳市第六人民医院疼痛科住院的35例带状疱疹患者,其中13例发病时间小于等于10天(VZVA),9例发病时间大于10天且小于等于30天(VZVB),13例发病时间大于30天(VZVC)进行研究,同时收集35例健康体检组(N)作为对照组。收集70例研究对象的资料,包括:住院资料、疼痛评分、粪便样品,利用磁珠法对粪便样品的DNA进行提取,在提取到的菌群DNA的基础上进行16SrRNAV4区PCR扩增,并将使用Thermofisher的IonS5TMXL进行上机测序,通过可操作分类单元(OTU)聚类分析及物种注释、α-多样性和β-多样性的结果进行物种组成差异分析和多样性分析。
【结果】
1.与正常健康人相比带状疱疹患者组粪便中细菌菌群物种OTU信息量明显增加(P<0.05),在多样性指数(chao指数、ace指数及observedSpecies指数)比较中正常组与患者组中存在显著差异(P<0.05),患者组多样性及丰度高于正常组。
2.在物种结构占比分析中,正常健康组与患者组相比,患者组中Bifidobacterium(乳酸杆菌)、Lactobacillus(双歧杆菌)的占比较正常组低,致病菌Actinobacteria(放线菌)、Fusobacteria(梭杆菌)占比较高。
3.组间的差异物种在门水平上VZVA与VZVB组之间差异物种为Fusobacteria(梭杆菌门),VZVA与VZVC组之间差异物种为Firmicutes(厚壁菌门)、Bacteroidetes(拟杆菌门),在科的水平上正常对照组与患者组出现差异菌群,正常组N与VZVB组和VZVC组差异菌均为Veillonellacea(韦荣球菌科)、Alcaligenaceae(产碱杆菌科),患者组中VZVA与VZVB组之间差异菌为Fusobacteriaceae,患者组中VZVA与VZVC组之间差异菌为Bacteroidaceae(拟杆菌科)、Lachnospiraceae(毛螺菌科),在属水平上,患者组与正常组之间有Parasutterella(副萨特氏菌属),unidentified_Ruminococcaceae,Megamonas(巨单胞菌属),Lachnoclostridium,Collinsella(柯林斯氏菌),等属群有差异,患者组(VZVA、VZVB、VZVC)两两组之间亦存在差异菌属(P<0.05)。
4.PCoA分析患者组(VZVA,VZVB,VZVC)肠道菌群可明显区分于正常健康组(N),表明正常健康组与患者组结构存在差异。
【结论】
带状疱疹患者肠道菌群与正常健康人相比,菌群多样性指数存在明显差异,带状疱疹患者肠道菌群多样性高于健康者;早期带状疱疹患者中益生菌较正常组占比少,早期带状疱疹患者中致病菌如放线菌、链球菌比例升高,乳酸杆菌、双歧杆菌等益生菌占比较健康者低。