【摘 要】
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犬布法病毒(Canine Bufavirus,CBuV)是细小病毒属的成员,与犬腹泻密切相关。CBuV于2018年首次在意大利的幼犬中发现,随后在中国也被报道,上海、广西和河南均有发现。目前安徽省尚无CBuV的报道,对其流行状况和进化状态尚不知晓,且缺乏有效的检测方法。在本研究中,我们收集了安徽地区动物医院的120份犬粪便样本,使用PCR共检出3份CBuV,并对3株完整的基因组序列进行扩增,扩增序
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犬布法病毒(Canine Bufavirus,CBuV)是细小病毒属的成员,与犬腹泻密切相关。CBuV于2018年首次在意大利的幼犬中发现,随后在中国也被报道,上海、广西和河南均有发现。目前安徽省尚无CBuV的报道,对其流行状况和进化状态尚不知晓,且缺乏有效的检测方法。在本研究中,我们收集了安徽地区动物医院的120份犬粪便样本,使用PCR共检出3份CBuV,并对3株完整的基因组序列进行扩增,扩增序列上传Genbank。通过相似度分析,遗传进化分析、选择压力和免疫表位分析来探究该病毒在安徽地区的进化状态。此外,本研究基于保守的NS1,利用一对特异性引物建立基于SYBR GreenⅠ的实时定量聚合酶链反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR)的检测方法,对CBuV进行定量检测。结果显示,CBuV全基因组同源性分别为99.3%、99.5%和98.9%,与其他参考株相似度为93.5%-99.5%,NS1其他参考株相似度为96.5%-100%,VP2为98.5%-99.8%。全基因组系统发育分析表明,CBuV形成三个分支,安徽地区获得的三株CBuV与中国其他省份获得的毒株明显不在一个分支,而与意大利的一个毒株关系密切;在VP2系统发育树中,中国毒株与欧洲毒株形成了两个单独的聚类,表明不同地理状态下的CBuV在VP2区域存在潜在的分化可能。VP2区域的选择压力分析表明,CBuV在进化过程中主要处于阴性选择压力。阴性选择位点位于B细胞表位的残基上,表明病毒的免疫原性的潜在变化很小,此外安徽株AH-001的VP2区域上存在潜在的重组事件,但这种重组并没有影响VP2的分化。在本研究建立的qPCR检测方法的敏感性实验中,基于SYBR GreenⅠ qPCR的实时定量PCR的检出限为4.676×10~1拷贝/μL,利用相同引物的常规PCR的检出限为4.676×10~3拷贝/μL。此外,qPCR方法与犬其他病毒不发生反应,具有特异性。组内变异系数为0.07%~0.55%,组间变异系数为0.03%~0.11%,有较稳定的重复性。在临床标本检测中,qPCR的检出率5.0%(6/120)比普通PCR的检出率(2.5%,3/120)高。综上所述,本研究是首次报道CBuV在安徽省犬中存在感染,有助于进一步了解CBuV的系统发育和分子特征,为CBuV的预防提供参考。本研究中建立的SYBR GreenⅠ qPCR方法对能够用于犬布法病毒的临床检测,可为今后CBuV的大规模检测提供帮助高效的诊断方法。
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