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采用ISSR分子标记技术对采集自10个不同地区的野生歪头菜自然居群的144个样本进行了遗传多样性分析,从加拿大British Columbia大学公布的100条ISSR引物序列中筛选了10条ISSR引物用于本研究,这些引物共扩增出120个ISSR片段,其中多态性片段117个,在居群内部多态位点比率变动范围为26.76%—49.70%。利用POPGENE软件对扩增结果进行了遗传多样性和遗传结构的分析。并在此研究的基础上,进一步探讨了歪头菜的遗传多样性与海拔、降雨量、土壤pH和土壤养分含量等环境因子的相关性,以探讨歪头菜遗传多样性与环境因素的关系。结果显示,物种水平上不同地区的歪头菜具有较高的遗传多样性,但超过半数的变异来源于不同居群之间(多态位点百分率PPB:97.5%;基因流Nm:0.4553;基因分化度Gst:0.5283;Nei’s基因多样性H:0.2632)。分子方差变异AMOVA分析也显示有50.51%遗传分化发生在不同的居群之间。本研究发现环境压力的不同对歪头菜遗传多样性具有选择作用,环境压力极小和环境压力极大的烟台和合作两个地区具有较高的遗传多样性,但环境压力介于二者之间的地区遗传多样性则相对较低。在不同微生境的选择下歪头菜不同居群间发生了进化分异,随着环境压力的增加歪头菜的遗传多样性呈高-低-高的变化趋势。本研究认为歪头菜的遗传多样性是各种因素综合作用的结果,与其生长地区的环境压力的大小有关而不与某一特定因素有因果关系。目前对于歪头菜的研究多集中于表型和生理方面,本研究在分子水平上对歪头菜进行了遗传多样性和遗传结构的分析,并结合环境因子与表型因素分析了不同微生境下歪头菜遗传多样性与环境的相关性。研究结果不仅对合理利用歪头菜遗传资源及育种具有重要的参考价值,而且在研究不同微生境下歪头菜的进化方向和其生长地区的环境的关系方面也具有指导意义,为后续对歪头菜的其它研究奠定了基础。