在养禽业中常见到一些生长发育严重受阻的鸡，俗称“小老鸡”或“僵鸡”，这种鸡全称为鸡生长受阻和发育障碍综合症(runting and stunting syndrome，RSS)。RSS鸡在规模化养鸡场和个体养殖户中均有发现。这类鸡主要表现为久养不大、只吃不长、体重体格上均比正常鸡小，羽毛生长较慢，还伴随有腹泻现象。这些鸡不仅消耗饲料，生长性能差，而且易患病，是一个潜在的传染源。由于RSS鸡的成因不明，在养殖中无法对症防治，往往只能采用现场观察及时淘汰、丢弃的措施来处理，一定程度上影响养殖效益。本研究在分析RSS鸡表型表现的基础上，用Solexa测序检测肝脏组织中mRNA与microRNA表达，研究生长受阻鸡的成因。RSS鸡解剖观察可见消化器官损伤，如肠道、肝脏和腺胃等均有症状表现，也存在一定比例没有明显病变的RSS鸡。选取52日龄新兴矮脚黄商品代肉鸡的正常个体与没有明显病变、没有ALV和REV感染的RSS个体为实验材料筛选其肝脏组织中差异表达的microRNA和mRNA，结果显示：RSS鸡与正常鸡比较，上调的microRNA有15个，下调的microRNA有7个，3个microRNA只在RSS鸡肝脏组织中表达；上调的基因有604个，下调的基因有555个。有6个基因只在RSS鸡肝脏组织中表达，分别是LOC415662、Clorf78、ZZEF1、CEBPA、LOC418836和FOXP2;有5个基因只在对照鸡肝脏组织中表达，分别是CINP、MYH3、EEF1A2、MAP3K13和IMMP1L。分析认为这些差异表达基因可能与RSS出现的影响因素有关，主要表现在氧化磷酸化、丙酮酸代谢、脂肪酸代谢以及胆汁酸生物合成等生物学通路上显著富集，涉及多个信号通路。利用DF-1鸡胚成纤维细胞系，在细胞水平上验证gga-miR-221、gga-miR-30b和gga-miR-30c的生物学功能，发现gga-miR-221影响MAP3K7IP2基因的表达水平，而gga-miR-30b和gga-miR-30c对CARS基因的表达情况有一定的影响。通过对差异表达基因MAP3K71P2及CARS部分序列进行变异筛查，发现这两个基因序列均有较丰富的多态性。　　 本文从表型、DNA、RNA三个水平上剖析RSS鸡形成的影响因素。