【摘 要】
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从序列出发预测水解酶亚家族类型具有重要意义.本文利用不同标度的伪氨基酸组成提取序列特征值,采用k-近邻算法预测水解酶亚家族类型.选择参数后,三种方法各自在最优运行参数
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从序列出发预测水解酶亚家族类型具有重要意义.本文利用不同标度的伪氨基酸组成提取序列特征值,采用k-近邻算法预测水解酶亚家族类型.选择参数后,三种方法各自在最优运行参数下预测水解酶亚家族的准确率分别为:85.15%,82.65%和80.14%.其中以Z标度的伪氨基酸组成效果最佳,比氨基酸组成识别精度提高12.85%.本文研究结果说明从序列出发,预测水解酶亚家族是可行的,且修正的伪氨基酸组成可望成为一种新的有效提取蛋白质序列特征值的方法.
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