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利用全要素生产率分析计算，从知识创新、技术创新、创新产业格局、创新环境、创新绩效等方面比较分析苏州自主创新发展现状，提出苏州应利用区域优势，积极承接上海世博会溢出效应，提升企业创新能力、优化苏州创新经济产业布局、增强苏州政府自主创新支撑力、促进产学研区域一体化联动创新、完善科技中介服务等自主创新发展战略，以期增强苏州自主创新能力，推动苏州创新经济协调可持续发展。