目的 研究吲哚-2-酮类化合物与蛋白酪氨酸磷酸酶1B(PTP1B)的结合方式,构建具有良好预测能力的三维定量构效关系(3D-QSAR)模型.方法 通过Surflex-Dock方法研究吲哚-2-酮类化合物与PTP1B的结合模式,基于分子对接构建比较分子场分析(CoMFA)和比较分子相似性指数分析(CoMSIA)模型,采用CoMFA和CoMSIA进行3D-QSAR研究.结果 与结论分子对接结果显示,吲哚-2-酮类化合物可以与靶酶的第二结合位点很好地结合.构建的CoMFA模型与CoMSIA模型的交叉验证系数q2分别为0.616和0.537.该类化合物可与PTP1B酶很好的结合,建立的CoMFA和CoMSIA模型均具有良好的预测能力,为该类化合物进一步设计成新的候选化合物提供理论依据.