【摘 要】
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目的了解河南省手足口病病原柯萨奇病毒B组4型(coxsackievirus B4,CV-B4)全基因组特征,分析不同疾病来源CV-B4病毒分离株VP1区基因异同。方法对采集的手足口病患者临床标本13
【机 构】
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河南省疾病预防控制中心传染病预防控制所河南省传染病病原生物重点实验室;
【基金项目】
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河南省医学科技攻关计划项目(201601028);河南省科技创新人才专项经费(164100510008)
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目的了解河南省手足口病病原柯萨奇病毒B组4型(coxsackievirus B4,CV-B4)全基因组特征,分析不同疾病来源CV-B4病毒分离株VP1区基因异同。方法对采集的手足口病患者临床标本134份进行RT-PCR扩增和病毒分离鉴定;对其中1株分离株通过4对引物分段扩增,拼接CV-B4分离株基因组序列,用生物信息学软件分析,构建序列遗传树。结果测序获得河南省CV-B4分离株HN23/CB4/CHN/2013基因组全长序列7 394 bp,5’非编码区(5’-UTR)、P1、P2、P3、3’非编码区(3’-UTR)区域核苷酸序列与Gen Bank公布的其他分离株相似性分别为80.3%~95.7%、80.8%~93.9%、78.6%~87.7%、78.1%~81.2%和66.7%~87.5%;VP1区核苷酸相似性为81.2%~93.2%,氨基酸相似性为96.1%~99.3%,与糖尿病患者分离株E2核苷酸差异最大,达28.8%,与手足口病分离株差异最小,为6.8%。结论 CV-B4病毒同种疾病分离株VP1区域核苷酸同源性较高,不同疾病分离株差异性较大。
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