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子午流注的思想发轫于中医的五运六气学说,其运用范围不仅限于针法,而且还应用于辨证、用药和养生方面。时间医学是研究生物体内与时间有关的周期性生物节律现象,或曰这些现象的时间机制。时间医学研究的目的是阐明生物体内生理和行为的时间机制。子午流注与时间医学的比较研究有助于子午流注理论的系统化与科学化,以及子午流注应用的规范化。