【摘 要】
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为了研究核桃EST序列的通用性以及山核桃的遗传多样性,从NCBI数据库的核桃EST序列中设计了20对引物,并从中筛选出6对,对24份山核桃以及27份核桃样品进行分析,共检测到46个位
【机 构】
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新疆农业大学,浙江农林大学亚热带森林培育国家重点实验室培养基地
【基金项目】
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国家林业公益性行业科研专项(201304701-1);自治区十二五科技重大专项(201130102-1);新疆自治区果树学重点学科基金项目
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为了研究核桃EST序列的通用性以及山核桃的遗传多样性,从NCBI数据库的核桃EST序列中设计了20对引物,并从中筛选出6对,对24份山核桃以及27份核桃样品进行分析,共检测到46个位点,其中多态性位点41个。利用Popgen32软件对6组引物进行分析。结果表明,观察等位基因数(N a)平均为1.869 6,有效等位基因数(N e)平均为1.623 4,基因多样性指数(H)平均为0.344 7,Shannon信息指数(I)平均为0.502 3。采用UPGMA法进行聚类分析,在相似系数为0.73时所有样品可明显区分为2个类群,说明由核桃EST筛选出的EST-SSR引物具有较好的通用性,可用于山核桃遗传分析、系统分类以及品种鉴定。
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