基于Smart Chip HT-qPCR分析不同食品中抗生素抗性基因的多样性及丰度

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抗生素抗性基因(Antibiotics Resistance Genes,ARGs)广泛存在于各种环境中,被认为是一种新型环境污染物,对环境及人类健康具有潜在威胁。但是目前对于不同食品中多种ARGs赋存状况的研究仍然有限。该研究采用Smart Chip高通量实时定量PCR方法(High-Throughput Quantitative Real-Time PCR,HT-q PCR)对水产品、发酵食品、肉类、蔬菜四大类样品中的ARGs及可移动遗传元件(Mobile Genetic Elements,MGEs)进行了定量分析。结果显示,被分析的15个样品中共检出9个ARGs大类,涉及234个ARGs亚类。所有样品中共有的ARGs亚类为79个,特有的为51个;水产品和肉类样品富集多种ARGs,这些基因表现出较高的丰度(最高可达3.6copies/16Sr RNAgene)。MGEs的检出数量达10个,其中所有样均检出整合子基因int I-1(clinic)和转座酶基因tnp A-01。ARGs抵抗机制分析结果表明,抗生素灭活机制、外排泵机制和细胞保护机制为主要的ARGs抵抗机制,抵抗机制贡献大小依次为:抗生素灭活机制>外排泵机制>细胞保护机制。该研究进一步丰富了对不同食品中ARGs赋存情况的认识,可为食品中ARGs的风险分析提供依据。
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