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以携带抗纹枯病QTLqSB-9TQ的籼稻品种特青和携带抗条纹叶枯病基因Stv-bi的粳稻品种镇稻88为优良等位基因供体亲本，江苏省推广的粳稻品种武育粳3号和武粳15为受体亲本，分别杂交并连续回交。在回交及自交分离世代，利用开发的覆盖目标基因区间的双侧分子标记对目标基因进行辅助选择。至回交BC4F1世代，同一遗传背景2个回交方向的中选单株间聚合杂交，获得2个目标基因位点均纯合的聚合F3株系。条纹叶枯病抗性鉴定和纹枯病抗性接种鉴定结果表明，聚合株系对条纹叶枯病均表现抗病；以0-9级评级标准评价，聚合株系的纹枯