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湿地自然保护区是由水、土、生物和人构成的生态系统,其自然资源和自然环境管理必然涉及多个管理部门。因此,应当按照生态系统管理思想,建立协调管理机制,成立合作管理机构,对湿地自然保护区自然资源和自然环境进行综合管理。《自然保护区法》等法律、法规中应当安排适当的原则和规则,综合考虑自然保护区跨部门管理问题。