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用细菌16S核糖体RNA基因(rDNA)限制性片段长度多型性描述了水环境细菌群落结构。从环境水样中直接分离DNA，以细菌特异的引物扩增16SrDNA，构建质粒文库，随机分离重组质粒，用限制性内切酶消化获得16SrDNA基因型，用基因型的种类及频率描述特定水体生境的细菌群落结构。该方法在分析水体隐含遗传多样性、揭示污染的生物学效应和评价水环境质量等方面具有重要的应用价值。