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选用13个水稻不育系和19恢复系按NCⅡ设计配制2套半双列杂交组合，分别用每套组合F1产量性状对该套亲本AFLP多态性位点（总位点）进行筛选，获得阳性、增效和减效三类位点。分别用基于总位点、阳性、增效和减效4类位点的亲本遗传距离构建AFLP标记预测模型，对另一套组合产量性状进行预测。结果表明：1）总位点中只有少数为阳性位点。与总位点相似，阳性位点用于产量性状预测时，预测值与实际值的相关系数（以下简称为预测系数）太低；2）而单独利用增效或减效位点，以及同时利用该2类位点（构建二元模型），3类预测效果均大大提