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目的：了解2011年河南洛阳和南阳地区流行的肠道病毒71型（EV71）基因特征。方法：分离洛阳和南阳地区EV71病毒各一株,分别进行全基因测序和基因进化分析。结果：EV71/Luoyang2011和EV71/Nanyang2011的VP1区序列在进化树上均属于C4亚型,与国内流行株都具有较高同源性,与2008年广东流行株亲缘关系最近。这2株全基因核苷酸序列同源性为99.3%,氨基酸序列同源性为97.6%,并且氨基酸均没有发生明显改变。结论：EV71/Luoyang2011和EV71/Nanyang2011