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利用DAMD，ISSR和RAPD3种不同类型的分子标记研究了作图亲本栽培甜瓜黄旦子与野生甜瓜PI414723间的多态性，结果表明，DAMD和ISSR揭示作图亲本间多态性的效率较高，而APD标记揭示作图亲本间多态性的效率较低，说明为了提高甜瓜作图效率，除了选择遗传差异相对较大杂交组合外，关键是选择高效揭示多态性的分子标记类型。