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本文依据GenBank上所收录的猪繁殖与呼吸综合症（PRRS）所有ORF5序列信息，通过以地域为依据进行划分，并选取各地代表菌株的此段序列，通过clustalx、MEGA、treevlew等程序，对其进行了序列比对，并以此建立起系统发育树分析四川高发蓝耳病病毒毒株的种属属性。研究结果证实，四川发生繁殖与呼吸综合症病毒毒株系美洲株系。同时也通过对所收录的两条四川不同毒株ORF5序列进行的比较，证实了猪繁殖与呼吸综合症病毒毒株其ORF5序列的高变异性。