【摘 要】
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目的 对2019-2020年辽宁省沿海城市甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)的基因特征进行分析.方法 选取2019-2020年辽宁省丹东、大连、盘锦市急性期甲型肝炎患者的血清或粪便标本(共162份),采用巢式PCR法进行HAV VP1/2A序列扩增,阳性样本进行基因测序,选取28个代表序列,同时从GenBank中下载全球HAV不同型别的基因序列,通过Neighbor-Joining方法构建亲缘关系进化树,分析基因序列同源性.结果 2019-2020年辽宁省沿海城市的162份甲型肝炎
【机 构】
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辽宁省疾病预防控制中心,辽宁沈阳110005;丹东市疾病预防控制中心,辽宁丹东118000;大连市疾病预防控制中心,辽宁大连116000;盘锦市疾病预防控制中心,辽宁盘锦124000
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目的 对2019-2020年辽宁省沿海城市甲型肝炎病毒(hepatitis A virus,HAV)的基因特征进行分析.方法 选取2019-2020年辽宁省丹东、大连、盘锦市急性期甲型肝炎患者的血清或粪便标本(共162份),采用巢式PCR法进行HAV VP1/2A序列扩增,阳性样本进行基因测序,选取28个代表序列,同时从GenBank中下载全球HAV不同型别的基因序列,通过Neighbor-Joining方法构建亲缘关系进化树,分析基因序列同源性.结果 2019-2020年辽宁省沿海城市的162份甲型肝炎患者血清及粪便标本中,PCR阳性127份,均为ⅠA型;构建的亲缘关系进化树可分为2个进化分支,即分支1和分支2,与日本、韩国流行HAV的核苷酸同源性分别达98.8％～100％和98.4％～100％.结论 2019-2020年辽宁省沿海城市HAV基因型均为ⅠA型,与日本、韩国流行的HAV属同一分支.本研究为辽宁省甲型肝炎的防控提供了实验依据.
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