【摘 要】
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ncRNA（非编码RNA）是一类重要的遗传物质,它通过多种机制调控着基因的表达。由于缺少编码RNA基因所具有的典型特征,ncRNA基因的检测成为生物信息学RNA研究领域的热点问题。QRNA
【基金项目】
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国家863计划资助项目（2007AA01Z106）
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ncRNA（非编码RNA）是一类重要的遗传物质,它通过多种机制调控着基因的表达。由于缺少编码RNA基因所具有的典型特征,ncRNA基因的检测成为生物信息学RNA研究领域的热点问题。QRNA是目前该领域最典型使用最广泛的程序之一,但受限于O（L3）计算复杂度,传统的软件预测方法并不能满足日常研究的需要。本文基于FPGA平台实现了一种细粒度的并行ncRNA检测算法,利用CPU加FPGA的方案对QRNA程序实现细粒度并行,采用按矩阵列循环划分的任务分配策略实现处理单元间的负载平衡;采用数据预取、滑动窗口和数据传
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