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目的
分析一例智力发育迟缓患儿的遗传学病因，并对患儿进行确诊。
方法收集患儿的临床资料，采集患者和正常表型亲代的外周血样提取基因组DNA。应用高通量测序法筛查、Sanger测序法验证TRAPPC9基因变异位点。通过蛋白质预测软件预测、相关数据库和PubMed文献检索变异位点的致病性。结合患者临床表现和相关检查结果，根据《遗传变异分类标准与指南》判断该基因变异的致病性。
结果患儿智力发育迟缓、语言发育迟缓、自理能力差；脑部成像显示脑沟裂增宽、蛛网膜下腔增宽、胼胝体压部发育不良等。测序发现患儿存在TRAPPC9基因c.1705T>C(p.S569P)、c.1708dupC(p.R570Pfs*80)和c.2273delA(p.N758Tfs*22)杂合变异。患儿母亲为TRAPPC9基因c.1705T>C(p.S569P)和c.1708dupC(p.R570Pfs*80)杂合变异携带者，患者父亲为TRAPPC9基因c.2273delA(p.N758Tfs*22)杂合变异携带者。
结论TRAPPC9基因c.1708dupC(p.R570Pfs*80)和c.2273delA(p.N758Tfs*22)复合杂合变异可能是该智力发育迟缓患儿的致病原因。该复合杂合变异未见文献报道，是智力发育迟缓13型的新致病变异。由于智力发育迟缓临床表现及遗传的异质性，针对性的基因检测对先天性发育迟缓的精确诊断具有重要的意义。