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研究广义Chaplygin系统的形式不变性，利用广义Chaplygin方程在无限小变换下的变形形式，给出广义Chaplygin系统的形式不变性的定义和判据．给出了广义Chaplygin系统的Noether对称性判据，并研究形式不变性和Noether对称性的关系．结果表明形式不变性与Noether对称性是两种不同的对称性，广义Chaplygin方程的形式不变性有可能是Noether对称性，也可能不是Noether对称性．最后举例说明结果的应用．