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生物多样性与生态工程教育部重点实验室是教育部于2000年批准成立的复旦大学与北京师范大学联合重点实验室,依托两个生态学国家重点学科点。重点实验室(复旦大学)是在生物多样性科学研究所的基础上发展而成的研究与教学实体,现有固定人员15人,其中教授6名,副教授7名,1人被聘为“长江奖励计划”的讲座教授,1名为复旦大学特聘教授,2名为国家杰出青年基金获得者。