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代谢物组学作为一种重要的功能基因组学工具，已经在微生物性状改良等方面得到了应用。实施代谢物组学研究需要定性和定量分析细胞内的全部代谢物。所以，必须有一种能够提供良好的重复性和相对抽提效率较高的细胞内代谢物抽提方法。本研究以特定厌氧条件下培养的大肠杆菌为研究对象，以电喷雾质谱直接进样测定为评价标准，比较并分析了冰甲醇、热乙醇和碱抽提3种抽提方法。结果显示，冰甲醇抽提的样品在电喷雾质谱实验中表现出良好的重复性和最高的峰强度，并能够同时检测到超过20种不同的胞内代谢物。